69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1682 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2176  Oligogalacturonide lyase  80.93 
 
 		 388 aa  689    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00249856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1884  Oligogalacturonide lyase  81.19 
 
 		 388 aa  690    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00177498  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1948  Oligogalacturonide lyase  79.64 
 
 		 388 aa  679    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000264473  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2056  Oligogalacturonide lyase  80.15 
 
 		 388 aa  688    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00529554  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1682  oligogalacturonide lyase  100 
 
 		 388 aa  816    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1792  oligogalacturonide lyase  100 
 
 		 388 aa  816    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512963  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2654  oligogalacturonate lyase  99.74 
 
 		 388 aa  815    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.619254  normal  0.0112854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3297  oligogalacturonide lyase  70.05 
 
 		 391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367487  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000912  oligogalacturonate lyase  68.31 
 
 		 385 aa  579  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3293  oligogalacturonide lyase  65.79 
 
 		 375 aa  536  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0773  oligogalacturonide lyase  57.59 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2370  oligogalacturonide lyase  29.62 
 
 		 383 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.612375 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3901  hypothetical protein  28.01 
 
 		 394 aa  106  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0134044  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0273  hypothetical protein  24.5 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.738007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2448  hypothetical protein  24.38 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.317121 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  26.32 
 
 		 461 aa  54.3  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3949  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.34 
 
 		 716 aa  53.1  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782575  normal  0.167111 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  25.67 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  25 
 
 		 445 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  26.17 
 
 		 451 aa  50.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1331  WD40 domain-containing protein  22.14 
 
 		 455 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  24.7 
 
 		 425 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  28.29 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  24.87 
 
 		 443 aa  47.4  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  24.87 
 
 		 443 aa  47.4  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  24.4 
 
 		 429 aa  46.6  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  25.14 
 
 		 439 aa  46.6  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  24.47 
 
 		 450 aa  46.6  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  25.87 
 
 		 434 aa  46.2  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  26.18 
 
 		 454 aa  46.2  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  23.81 
 
 		 443 aa  46.2  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  25 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  26.9 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  26.9 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  27.59 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  26.9 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  23.24 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  23.37 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  23.21 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  24.7 
 
 		 450 aa  44.3  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  26.85 
 
 		 442 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  25.27 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  24.83 
 
 		 441 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  25.9 
 
 		 441 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  23.44 
 
 		 449 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  24.26 
 
 		 445 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  23.44 
 
 		 444 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  25.61 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  23.37 
 
 		 444 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  35.59 
 
 		 434 aa  43.9  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  21.46 
 
 		 416 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  27.16 
 
 		 430 aa  43.5  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2902  translocation protein TolB  30.53 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000513444  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  25.71 
 
 		 451 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  24.83 
 
 		 442 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  23.37 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  23.37 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  24.83 
 
 		 442 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  28.38 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  24.83 
 
 		 442 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  26.13 
 
 		 441 aa  43.1  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  24.83 
 
 		 442 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  26.25 
 
 		 442 aa  43.1  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1156  translocation protein TolB  27.33 
 
 		 428 aa  42.7  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  23.28 
 
 		 1111 aa  43.1  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1238  translocation protein TolB  26.38 
 
 		 430 aa  42.7  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00586154  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  25.5 
 
 		 440 aa  42.7  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  26.9 
 
 		 442 aa  42.7  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  23.91 
 
 		 462 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>