20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0773 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0773  oligogalacturonide lyase  100 
 
 		 382 aa  802    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1682  oligogalacturonide lyase  57.59 
 
 		 388 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1884  Oligogalacturonide lyase  58.64 
 
 		 388 aa  482  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00177498  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1792  oligogalacturonide lyase  57.59 
 
 		 388 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2056  Oligogalacturonide lyase  57.59 
 
 		 388 aa  483  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00529554  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2176  Oligogalacturonide lyase  58.64 
 
 		 388 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00249856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1948  Oligogalacturonide lyase  57.85 
 
 		 388 aa  481  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000264473  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2654  oligogalacturonate lyase  57.33 
 
 		 388 aa  481  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.619254  normal  0.0112854 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000912  oligogalacturonate lyase  53.68 
 
 		 385 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3297  oligogalacturonide lyase  53.4 
 
 		 391 aa  449  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367487  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3293  oligogalacturonide lyase  50.92 
 
 		 375 aa  418  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2370  oligogalacturonide lyase  26.79 
 
 		 383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.612375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0273  hypothetical protein  24.88 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.738007 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3901  hypothetical protein  26.54 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0134044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2448  hypothetical protein  22.79 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.317121 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  25.91 
 
 		 461 aa  52.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1331  WD40 domain-containing protein  25.7 
 
 		 455 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  29.11 
 
 		 434 aa  46.6  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  35 
 
 		 437 aa  43.9  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  35 
 
 		 440 aa  43.9  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>