283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0114 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0114  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 295 aa  608  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1560  sensory box sensor histidine kinase  52.36 
 
 		 344 aa  259  3e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0374606  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1317  sensory box sensor histidine kinase  41.02 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_92  sensor histidine kinase  33.06 
 
 		 363 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0294  histidine kinase  34.59 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1372  sensor histidine kinase  25.19 
 
 		 377 aa  85.5  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2350  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  34.26 
 
 		 1000 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.521127 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  33.05 
 
 		 659 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 661 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 1039 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  30.25 
 
 		 602 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1021 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  30.67 
 
 		 1239 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1539  sensory box sensor histidine kinase  32.62 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0780  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.96 
 
 		 520 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0195559  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  24.36 
 
 		 1101 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 748 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 		 981 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  33.61 
 
 		 744 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  25.38 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  24.38 
 
 		 1561 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  27.27 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 1399 aa  60.1  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  34.86 
 
 		 1379 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1431  sensory box sensor histidine kinase  31.91 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 		 1184 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  22.31 
 
 		 585 aa  59.7  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  24.5 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  27.62 
 
 		 882 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 1053 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 681 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.36 
 
 		 1184 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 957 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 940 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 883 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.78 
 
 		 947 aa  57  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1010  signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 626 aa  56.6  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4360  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.36 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.55 
 
 		 1134 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0836  putative PAS/PAC sensor protein  31.19 
 
 		 487 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  24.36 
 
 		 1226 aa  55.8  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 1229 aa  55.8  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  26.32 
 
 		 844 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  28 
 
 		 1346 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  32.41 
 
 		 1258 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 363 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 		 371 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1054 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  28.42 
 
 		 1015 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 		 774 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 		 1068 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 407 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.512504  normal  0.0507183 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 2072 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 673 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 1568 aa  53.5  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0821  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.7 
 
 		 473 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  25.65 
 
 		 387 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.9 
 
 		 1271 aa  53.1  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.36 
 
 		 1258 aa  52.8  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 382 aa  52.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0309  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.85 
 
 		 827 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0510078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 945 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 1301 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 653 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 642 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 		 366 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 		 1262 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0171  sensory box sensor histidine kinase  25.57 
 
 		 503 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 		 1322 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 		 657 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  26.42 
 
 		 632 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0047  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.56 
 
 		 738 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846465 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  29.91 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 		 995 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 913 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.86 
 
 		 1648 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1480  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25 
 
 		 1012 aa  50.4  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 		 1309 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 1050 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1538  putative PAS/PAC sensor protein  27.5 
 
 		 495 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_93  sensor histidine kinase  31 
 
 		 759 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1026  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 599 aa  49.7  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0934785  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.15 
 
 		 370 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 613 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2112  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.64 
 
 		 836 aa  49.7  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 748 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 1225 aa  49.7  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  25 
 
 		 749 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  28.68 
 
 		 982 aa  49.3  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1138  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283837  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 614 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1146  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.61 
 
 		 909 aa  49.3  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2688  putative PAS/PAC sensor protein  27.93 
 
 		 937 aa  49.3  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.139133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 378 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.2 
 
 		 1442 aa  49.3  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.53 
 
 		 862 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1651  PAS sensor protein  24.8 
 
 		 895 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2056  histidine kinase  27.27 
 
 		 475 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>