More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1076 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1076  alpha amylase domain-containing protein  100 
 
 		 685 aa  1390    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.819574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3868  alpha amylase catalytic region  31.43 
 
 		 752 aa  336  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0138  alpha amylase, catalytic region  32.26 
 
 		 732 aa  317  7e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0393  alpha amylase catalytic region  33.28 
 
 		 735 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0232636 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  24.23 
 
 		 422 aa  97.1  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  23.71 
 
 		 422 aa  92  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  23.15 
 
 		 434 aa  83.2  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  30.08 
 
 		 426 aa  83.2  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  26.87 
 
 		 463 aa  83.2  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  23.78 
 
 		 459 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  24.24 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  23.94 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  31.82 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  30.08 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  27.56 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1176  alpha-amylase family protein  34.26 
 
 		 634 aa  68.2  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.470418  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  27.68 
 
 		 1122 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  34.48 
 
 		 734 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  34.48 
 
 		 715 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  36.94 
 
 		 688 aa  65.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  32.76 
 
 		 1122 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  31.03 
 
 		 1124 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  31.03 
 
 		 1124 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  30.97 
 
 		 1048 aa  63.9  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1209  alpha amylase, catalytic region  32.23 
 
 		 657 aa  63.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  34.48 
 
 		 1022 aa  62.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  30.77 
 
 		 1146 aa  62  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  32.17 
 
 		 549 aa  61.6  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  31.03 
 
 		 1124 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3155  hypothetical protein  31.45 
 
 		 664 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  30.17 
 
 		 1126 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  30.77 
 
 		 1151 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  35.79 
 
 		 558 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36740  hypothetical protein  31.45 
 
 		 664 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.759208  normal  0.786637 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0829  Alpha amylase, catalytic region  33.33 
 
 		 662 aa  59.7  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.673433  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1466  alpha amylase, catalytic region  30.58 
 
 		 657 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1105  alpha amylase catalytic region  27.22 
 
 		 705 aa  59.7  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  30.77 
 
 		 1148 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4097  alpha amylase catalytic sub domain protein  28.65 
 
 		 672 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0571346  normal  0.0314797 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  30.77 
 
 		 1115 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  30.77 
 
 		 1115 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2295  alpha amylase, catalytic region  32.14 
 
 		 660 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0369553  hitchhiker  0.000002386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2023  alpha amylase, catalytic region  28.3 
 
 		 707 aa  58.5  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685343 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  29.06 
 
 		 1144 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2089  alpha amylase catalytic region  26.09 
 
 		 679 aa  57.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  30.97 
 
 		 671 aa  57.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1979  alpha amylase catalytic region  26.14 
 
 		 684 aa  57.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379903  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  32.43 
 
 		 816 aa  57.8  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  29.66 
 
 		 1136 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  29.66 
 
 		 1133 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  29.91 
 
 		 1115 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1381  alpha-amylase family protein  29.03 
 
 		 661 aa  57.4  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  29.91 
 
 		 1136 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  29.91 
 
 		 1115 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  29.66 
 
 		 1131 aa  57  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0135  alpha amylase catalytic region  32.46 
 
 		 660 aa  56.6  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2161  alpha amylase  25.99 
 
 		 680 aa  57  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  30.77 
 
 		 1037 aa  57  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0314  alpha amylase, catalytic region  27.06 
 
 		 646 aa  57  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  31.9 
 
 		 724 aa  57  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3071  alpha amylase catalytic region  25.99 
 
 		 674 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224313  normal  0.685148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  27.82 
 
 		 964 aa  56.6  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  30.17 
 
 		 672 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  30 
 
 		 550 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  32.76 
 
 		 708 aa  56.6  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1085  alpha-amylase family protein  31.19 
 
 		 649 aa  56.6  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151666  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4060  alpha-amylase family protein  30.17 
 
 		 661 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203382  normal  0.586391 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0818  maltooligosyl trehalose trehalohydrolase, putative  28.36 
 
 		 580 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238296  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1783  alpha amylase, catalytic region  30.17 
 
 		 672 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00829372  normal  0.075062 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  20.85 
 
 		 478 aa  55.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1336  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  28.36 
 
 		 580 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.844442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0538  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  28.36 
 
 		 580 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79822  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1541  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.36 
 
 		 634 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0617  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  28.36 
 
 		 580 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.357584  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1815  alpha amylase catalytic region  29.46 
 
 		 672 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.474679  normal  0.202822 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0116  alpha amylase catalytic region  31.58 
 
 		 660 aa  54.7  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0759289 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  24.22 
 
 		 654 aa  54.7  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3678  alpha amylase, catalytic region  30.58 
 
 		 659 aa  54.7  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  30.17 
 
 		 1075 aa  54.3  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  29.31 
 
 		 507 aa  54.3  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6825  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.42 
 
 		 640 aa  54.3  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309899  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  27.91 
 
 		 672 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3176  alpha amylase catalytic region  27.66 
 
 		 682 aa  54.3  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000122162  hitchhiker  0.0000126185 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  29.06 
 
 		 1130 aa  54.3  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  29.31 
 
 		 1074 aa  54.3  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0963  alpha-amylase family protein  31.19 
 
 		 638 aa  53.9  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  28.45 
 
 		 1142 aa  53.9  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  26.75 
 
 		 555 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  28.21 
 
 		 1130 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.7 
 
 		 553 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  28.21 
 
 		 1130 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1356  alpha amylase catalytic region  31.48 
 
 		 642 aa  53.5  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000107731  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  28.21 
 
 		 1130 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  29.01 
 
 		 550 aa  53.9  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  27.59 
 
 		 531 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  25 
 
 		 420 aa  53.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  28.45 
 
 		 672 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1884  alpha amylase, catalytic region  28.1 
 
 		 684 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  26.01 
 
 		 1145 aa  53.1  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0153  alpha amylase catalytic region  25.52 
 
 		 652 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>