235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1381 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1524  alpha-amylase family protein  64.54 
 
 		 636 aa  866    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0281474  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1176  alpha-amylase family protein  59.53 
 
 		 634 aa  796    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.470418  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1381  alpha-amylase family protein  100 
 
 		 661 aa  1375    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0963  alpha-amylase family protein  59.17 
 
 		 638 aa  816    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1085  alpha-amylase family protein  58.39 
 
 		 649 aa  808    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151666  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1122  alpha-amylase family protein  55.12 
 
 		 629 aa  750    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110561  normal  0.457089 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1356  alpha amylase catalytic region  56.12 
 
 		 642 aa  756    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000107731  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0458  alpha amylase, catalytic region  30.73 
 
 		 663 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1144  alpha amylase catalytic region  29.75 
 
 		 669 aa  250  5e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00833327  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0143  alpha amylase catalytic sub domain protein  29.48 
 
 		 692 aa  241  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0052779  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0159  hypothetical protein  30.92 
 
 		 637 aa  239  8e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00185609  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0161  alpha amylase, catalytic region  30.92 
 
 		 637 aa  239  8e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00960046  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0463  alpha amylase domain-containing protein  29.8 
 
 		 676 aa  203  9e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.694726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  33.33 
 
 		 426 aa  88.2  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  37.61 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  32.17 
 
 		 434 aa  79.7  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  29.37 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  37.29 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  37.29 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  35.14 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  35.19 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  37.04 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  25.35 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  37.93 
 
 		 715 aa  67.4  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  37.93 
 
 		 734 aa  66.6  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  29.14 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  28.87 
 
 		 1037 aa  63.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  27.51 
 
 		 1136 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  27.51 
 
 		 1133 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1815  alpha amylase catalytic region  24.89 
 
 		 672 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.474679  normal  0.202822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  33.62 
 
 		 1124 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  33.62 
 
 		 1124 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  33.62 
 
 		 1124 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0034  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 663 aa  61.2  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  36.21 
 
 		 671 aa  61.2  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  34.48 
 
 		 1122 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  33.62 
 
 		 1122 aa  60.8  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  29.17 
 
 		 1151 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  36.21 
 
 		 724 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0135  alpha amylase catalytic region  33.62 
 
 		 660 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0116  alpha amylase catalytic region  28.74 
 
 		 660 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0759289 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  29.17 
 
 		 1146 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  32.76 
 
 		 1126 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  29.58 
 
 		 1022 aa  58.9  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2089  alpha amylase catalytic region  36.84 
 
 		 679 aa  58.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  35.65 
 
 		 716 aa  58.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  29.73 
 
 		 1148 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1727  alpha amylase catalytic region  33.91 
 
 		 705 aa  58.2  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  29.73 
 
 		 1136 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  29.73 
 
 		 1115 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  29.73 
 
 		 1115 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  30.56 
 
 		 1048 aa  58.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3860  alpha amylase, catalytic region  29.49 
 
 		 695 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3934  alpha amylase, catalytic region  29.49 
 
 		 695 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.538651 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  29.73 
 
 		 1115 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  29.73 
 
 		 1115 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3846  alpha amylase, catalytic region  29.49 
 
 		 695 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0237577 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  30.34 
 
 		 1130 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  29.17 
 
 		 1130 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  29.17 
 
 		 1130 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1076  alpha amylase domain-containing protein  29.03 
 
 		 685 aa  57.4  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.819574 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  29.17 
 
 		 1130 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3176  alpha amylase catalytic region  33.06 
 
 		 682 aa  57.4  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000122162  hitchhiker  0.0000126185 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  31.76 
 
 		 688 aa  56.6  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4060  alpha-amylase family protein  28.17 
 
 		 661 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203382  normal  0.586391 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  25.93 
 
 		 672 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  27.78 
 
 		 1131 aa  56.2  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2030  alpha amylase domain-containing protein  31.9 
 
 		 672 aa  56.6  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.219861  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1783  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 672 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00829372  normal  0.075062 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1884  alpha amylase, catalytic region  33.62 
 
 		 684 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  26.22 
 
 		 654 aa  55.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0153  alpha amylase catalytic region  34.48 
 
 		 652 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  27.78 
 
 		 1144 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11359  glucanase glgE  29.49 
 
 		 701 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.759121 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0210  alpha amylase catalytic region  32.2 
 
 		 676 aa  55.1  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28010  family 13 glycosyl hydrolase  29.17 
 
 		 667 aa  55.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0679  alpha amylase, catalytic region  34.78 
 
 		 653 aa  55.5  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10340  glycosidase  32.5 
 
 		 663 aa  55.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  29.82 
 
 		 651 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4100  alpha amylase catalytic region  30.3 
 
 		 687 aa  55.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1279  alpha amylase catalytic region  32.41 
 
 		 666 aa  54.7  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0559691  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1984  alpha amylase domain-containing protein  33.62 
 
 		 671 aa  54.7  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4301  alpha amylase, catalytic region  28.85 
 
 		 696 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1956  alpha amylase catalytic region  30.52 
 
 		 666 aa  53.9  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6072  alpha amylase catalytic region  30.34 
 
 		 659 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0393  alpha amylase catalytic region  34.55 
 
 		 735 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0232636 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  28.08 
 
 		 641 aa  53.5  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  29.49 
 
 		 816 aa  53.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  25.4 
 
 		 672 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2858  alpha amylase catalytic region  31.54 
 
 		 681 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1209  alpha amylase, catalytic region  29.31 
 
 		 657 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1297  alpha amylase catalytic region  36.52 
 
 		 667 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.774826  normal  0.698008 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  27.78 
 
 		 1082 aa  53.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3482  alpha amylase, catalytic region  31.9 
 
 		 651 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3071  alpha amylase catalytic region  29.07 
 
 		 674 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224313  normal  0.685148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2344  alpha amylase, catalytic region  28.21 
 
 		 696 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969175  normal  0.43625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2295  alpha amylase, catalytic region  25.59 
 
 		 660 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0369553  hitchhiker  0.000002386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1052  alpha amylase catalytic region  33.04 
 
 		 672 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  27.78 
 
 		 672 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3678  alpha amylase, catalytic region  32.17 
 
 		 672 aa  52  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.763851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>