263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0458 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1144  alpha amylase catalytic region  61.17 
 
 		 669 aa  841    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00833327  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0458  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 663 aa  1336    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0159  hypothetical protein  56.65 
 
 		 637 aa  714    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00185609  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0161  alpha amylase, catalytic region  56.65 
 
 		 637 aa  714    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00960046  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0463  alpha amylase domain-containing protein  46.73 
 
 		 676 aa  556  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.694726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0143  alpha amylase catalytic sub domain protein  43.11 
 
 		 692 aa  499  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0052779  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1356  alpha amylase catalytic region  33.56 
 
 		 642 aa  281  3e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000107731  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1524  alpha-amylase family protein  32.08 
 
 		 636 aa  280  7e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0281474  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1122  alpha-amylase family protein  32.15 
 
 		 629 aa  271  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110561  normal  0.457089 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1176  alpha-amylase family protein  32.41 
 
 		 634 aa  270  8e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.470418  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1381  alpha-amylase family protein  30.73 
 
 		 661 aa  267  4e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1085  alpha-amylase family protein  34.27 
 
 		 649 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151666  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0963  alpha-amylase family protein  30.8 
 
 		 638 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  32.35 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  36.3 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  34.78 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  28.91 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  34.93 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  31.3 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  29.1 
 
 		 426 aa  73.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  31.45 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  33.33 
 
 		 715 aa  70.5  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  26.96 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  33.33 
 
 		 734 aa  68.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  29.05 
 
 		 1122 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  30.43 
 
 		 460 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  35.04 
 
 		 671 aa  64.7  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  34.17 
 
 		 1037 aa  64.7  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  31.62 
 
 		 1136 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  31.62 
 
 		 1133 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3868  alpha amylase catalytic region  32.43 
 
 		 752 aa  64.3  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  24.04 
 
 		 586 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  31.62 
 
 		 1124 aa  63.9  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  34.19 
 
 		 1122 aa  63.9  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  31.62 
 
 		 1151 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1815  alpha amylase catalytic region  30.83 
 
 		 672 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.474679  normal  0.202822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  31.62 
 
 		 1124 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  33.04 
 
 		 688 aa  63.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  24.04 
 
 		 586 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4060  alpha-amylase family protein  30.83 
 
 		 661 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203382  normal  0.586391 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  31.62 
 
 		 1130 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1884  alpha amylase, catalytic region  32.48 
 
 		 684 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1783  alpha amylase, catalytic region  30.83 
 
 		 672 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00829372  normal  0.075062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2534  Alpha amylase, catalytic region  29.91 
 
 		 664 aa  62  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  31.62 
 
 		 1124 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4301  alpha amylase, catalytic region  30.89 
 
 		 696 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844806 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28010  family 13 glycosyl hydrolase  30.77 
 
 		 667 aa  61.6  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  31.62 
 
 		 1146 aa  62  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  24.68 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  30.77 
 
 		 1131 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  31.67 
 
 		 724 aa  60.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  30.83 
 
 		 1136 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  30.83 
 
 		 1115 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  30.83 
 
 		 1115 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  30.83 
 
 		 1148 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3482  alpha amylase, catalytic region  30.77 
 
 		 651 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  30.77 
 
 		 1130 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  30.77 
 
 		 1130 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  30.77 
 
 		 1130 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0679  alpha amylase, catalytic region  30.77 
 
 		 653 aa  60.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2089  alpha amylase catalytic region  33.91 
 
 		 679 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  30.83 
 
 		 1115 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  30.83 
 
 		 1115 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2344  alpha amylase, catalytic region  30.08 
 
 		 696 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969175  normal  0.43625 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  30.83 
 
 		 816 aa  60.1  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  31.62 
 
 		 1126 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  30 
 
 		 672 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  28.32 
 
 		 672 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1209  alpha amylase, catalytic region  31.62 
 
 		 657 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3176  alpha amylase catalytic region  31.67 
 
 		 682 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000122162  hitchhiker  0.0000126185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3583  alpha amylase catalytic region  31.9 
 
 		 684 aa  59.7  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  23.72 
 
 		 586 aa  59.7  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09540  glycosidase  30.83 
 
 		 715 aa  59.7  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0200177  normal  0.351025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  30.43 
 
 		 651 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  22.65 
 
 		 586 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  31.62 
 
 		 1022 aa  58.9  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4658  alpha amylase catalytic region  30.83 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  31.03 
 
 		 716 aa  58.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  28.21 
 
 		 672 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  26.14 
 
 		 1144 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0153  alpha amylase catalytic region  31.06 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11359  glucanase glgE  31.3 
 
 		 701 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.759121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1052  alpha amylase catalytic region  30.77 
 
 		 672 aa  57.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2030  alpha amylase domain-containing protein  26.54 
 
 		 672 aa  57.8  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.219861  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4100  alpha amylase catalytic region  28.46 
 
 		 687 aa  57.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0585  alpha amylase domain-containing protein  31.03 
 
 		 655 aa  57.4  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  23.4 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  23.4 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  23.4 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  24.35 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  23.4 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3678  alpha amylase, catalytic region  29.91 
 
 		 659 aa  57.4  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0034  alpha amylase catalytic region  25.49 
 
 		 663 aa  57.4  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3071  alpha amylase catalytic region  30.17 
 
 		 674 aa  57.4  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224313  normal  0.685148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  23.4 
 
 		 586 aa  57  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  24.13 
 
 		 586 aa  57  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1466  alpha amylase, catalytic region  29.2 
 
 		 657 aa  57  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3860  alpha amylase, catalytic region  28.46 
 
 		 695 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  29.91 
 
 		 1082 aa  57  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0135  alpha amylase catalytic region  30.77 
 
 		 660 aa  57  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>