278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1085 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1122  alpha-amylase family protein  59.23 
 
 		 629 aa  788    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110561  normal  0.457089 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1176  alpha-amylase family protein  55.59 
 
 		 634 aa  733    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.470418  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1381  alpha-amylase family protein  58.23 
 
 		 661 aa  805    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0963  alpha-amylase family protein  65.62 
 
 		 638 aa  884    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1524  alpha-amylase family protein  60.28 
 
 		 636 aa  803    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0281474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1085  alpha-amylase family protein  100 
 
 		 649 aa  1347    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151666  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1356  alpha amylase catalytic region  58.22 
 
 		 642 aa  783    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000107731  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0458  alpha amylase, catalytic region  34.27 
 
 		 663 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1144  alpha amylase catalytic region  32.61 
 
 		 669 aa  251  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00833327  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0143  alpha amylase catalytic sub domain protein  32.82 
 
 		 692 aa  249  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0052779  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0161  alpha amylase, catalytic region  31.28 
 
 		 637 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00960046  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0159  hypothetical protein  31.28 
 
 		 637 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00185609  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0463  alpha amylase domain-containing protein  31.16 
 
 		 676 aa  220  7e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.694726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  32.65 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  40.37 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  38.53 
 
 		 422 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  33.81 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  31.69 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  33.57 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  35.19 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  30.14 
 
 		 459 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  33.33 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  31.79 
 
 		 964 aa  63.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2030  alpha amylase domain-containing protein  29.73 
 
 		 672 aa  62  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.219861  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  33.09 
 
 		 716 aa  62  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  32.41 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 		 1048 aa  58.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  24.83 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  29.93 
 
 		 715 aa  57.4  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  28.76 
 
 		 1122 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1076  alpha amylase domain-containing protein  31.19 
 
 		 685 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.819574 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  27.94 
 
 		 1136 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  29.63 
 
 		 1124 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  29.93 
 
 		 734 aa  56.2  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  27.94 
 
 		 1133 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  29.63 
 
 		 1126 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  29.63 
 
 		 1124 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  29.63 
 
 		 1124 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1727  alpha amylase catalytic region  28.87 
 
 		 705 aa  55.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0034  alpha amylase catalytic region  27.21 
 
 		 663 aa  55.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  28.48 
 
 		 552 aa  55.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  28.68 
 
 		 1146 aa  55.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  28.76 
 
 		 1122 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  27.46 
 
 		 1148 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4100  alpha amylase catalytic region  29.55 
 
 		 687 aa  54.7  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  27.46 
 
 		 1136 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3846  alpha amylase, catalytic region  25.32 
 
 		 695 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0237577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3860  alpha amylase, catalytic region  26.63 
 
 		 695 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  28.87 
 
 		 671 aa  54.3  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3934  alpha amylase, catalytic region  26.63 
 
 		 695 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.538651 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  27.46 
 
 		 1115 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  27.46 
 
 		 1115 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  27.46 
 
 		 1115 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  27.46 
 
 		 1115 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10340  glycosidase  27.96 
 
 		 663 aa  53.9  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11359  glucanase glgE  28.26 
 
 		 701 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.759121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3176  alpha amylase catalytic region  28.17 
 
 		 682 aa  53.9  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000122162  hitchhiker  0.0000126185 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  26.83 
 
 		 654 aa  53.9  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  27.74 
 
 		 483 aa  53.9  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1956  alpha amylase catalytic region  28.14 
 
 		 666 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1279  alpha amylase catalytic region  28.31 
 
 		 666 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0559691  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  27.94 
 
 		 1151 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1984  alpha amylase domain-containing protein  29.25 
 
 		 671 aa  53.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  25.33 
 
 		 651 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  27.44 
 
 		 543 aa  53.5  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0679  alpha amylase, catalytic region  26.74 
 
 		 653 aa  53.5  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  26.81 
 
 		 481 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1815  alpha amylase catalytic region  26.39 
 
 		 672 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.474679  normal  0.202822 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  28.48 
 
 		 639 aa  53.9  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3868  alpha amylase catalytic region  31.82 
 
 		 752 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0116  alpha amylase catalytic region  27.78 
 
 		 660 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0759289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  29.79 
 
 		 1092 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1337  alpha amylase catalytic region  28.76 
 
 		 678 aa  53.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  27.89 
 
 		 1037 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0153  alpha amylase catalytic region  28.38 
 
 		 652 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09540  glycosidase  30.5 
 
 		 715 aa  52.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0200177  normal  0.351025 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  28.67 
 
 		 724 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  27.14 
 
 		 420 aa  52  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2858  alpha amylase catalytic region  28.47 
 
 		 681 aa  52.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0135  alpha amylase catalytic region  27.94 
 
 		 660 aa  52.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19040  glycosidase  29.41 
 
 		 675 aa  52.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.000683856  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  32.35 
 
 		 1106 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0210  alpha amylase catalytic region  28.67 
 
 		 676 aa  52  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0249  alpha amylase catalytic region  29.93 
 
 		 656 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.852341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  31.62 
 
 		 1106 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  27.86 
 
 		 1130 aa  51.6  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1884  alpha amylase, catalytic region  28.29 
 
 		 684 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  27.21 
 
 		 1130 aa  51.2  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  27.21 
 
 		 1130 aa  51.2  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  31.62 
 
 		 1106 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  27.21 
 
 		 1130 aa  51.2  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6072  alpha amylase catalytic region  29.37 
 
 		 659 aa  51.6  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4060  alpha-amylase family protein  26.43 
 
 		 661 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203382  normal  0.586391 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.03 
 
 		 561 aa  51.2  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  25.79 
 
 		 815 aa  51.2  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  28.17 
 
 		 816 aa  51.2  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1783  alpha amylase, catalytic region  26.43 
 
 		 672 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00829372  normal  0.075062 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  29.87 
 
 		 1093 aa  51.2  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  27.08 
 
 		 1082 aa  50.8  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  28.68 
 
 		 1105 aa  50.8  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>