194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0963 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1176  alpha-amylase family protein  58.69 
 
 		 634 aa  780    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.470418  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1381  alpha-amylase family protein  60.9 
 
 		 661 aa  815    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1085  alpha-amylase family protein  65.62 
 
 		 649 aa  884    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151666  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1356  alpha amylase catalytic region  58.93 
 
 		 642 aa  785    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000107731  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0963  alpha-amylase family protein  100 
 
 		 638 aa  1321    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1524  alpha-amylase family protein  60.6 
 
 		 636 aa  812    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0281474  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1122  alpha-amylase family protein  58.02 
 
 		 629 aa  763    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110561  normal  0.457089 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1144  alpha amylase catalytic region  32.06 
 
 		 669 aa  256  8e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00833327  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0143  alpha amylase catalytic sub domain protein  30.13 
 
 		 692 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0052779  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0458  alpha amylase, catalytic region  30.8 
 
 		 663 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0159  hypothetical protein  29.45 
 
 		 637 aa  244  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00185609  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0161  alpha amylase, catalytic region  29.45 
 
 		 637 aa  244  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00960046  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0463  alpha amylase domain-containing protein  27.37 
 
 		 676 aa  213  7e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.694726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  36.42 
 
 		 426 aa  90.5  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  30.12 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  39.45 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  33.1 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  33.33 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  34.48 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  33.11 
 
 		 459 aa  76.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  40.71 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  38.94 
 
 		 422 aa  76.3  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  30.99 
 
 		 426 aa  73.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3176  alpha amylase catalytic region  35.54 
 
 		 682 aa  67  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000122162  hitchhiker  0.0000126185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  39.13 
 
 		 716 aa  65.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  32.12 
 
 		 1133 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  32.12 
 
 		 1136 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  30.72 
 
 		 1122 aa  63.9  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  34.26 
 
 		 459 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  34.48 
 
 		 715 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6072  alpha amylase catalytic region  34.93 
 
 		 659 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  32.86 
 
 		 1037 aa  63.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10340  glycosidase  37.7 
 
 		 663 aa  62.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  35.34 
 
 		 1124 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  35.34 
 
 		 1124 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  35.34 
 
 		 1124 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1956  alpha amylase catalytic region  34.93 
 
 		 666 aa  62.4  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  34.48 
 
 		 734 aa  62.4  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1279  alpha amylase catalytic region  34.48 
 
 		 666 aa  62.4  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0559691  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4100  alpha amylase catalytic region  35.88 
 
 		 687 aa  62.4  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1297  alpha amylase catalytic region  37.39 
 
 		 667 aa  62  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.774826  normal  0.698008 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  31.37 
 
 		 1122 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0034  alpha amylase catalytic region  32.67 
 
 		 663 aa  61.6  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 651 aa  61.6  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  33.09 
 
 		 1151 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11359  glucanase glgE  36.3 
 
 		 701 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.759121 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1337  alpha amylase catalytic region  36.67 
 
 		 678 aa  61.2  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  33.62 
 
 		 1126 aa  60.8  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  33.09 
 
 		 1146 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  34.48 
 
 		 671 aa  60.1  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  31.39 
 
 		 1130 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  31.39 
 
 		 1130 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  34.48 
 
 		 1082 aa  59.7  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  31.39 
 
 		 1130 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3583  alpha amylase catalytic region  35.65 
 
 		 684 aa  59.7  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4097  alpha amylase catalytic sub domain protein  36.21 
 
 		 672 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0571346  normal  0.0314797 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09540  glycosidase  35 
 
 		 715 aa  59.3  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0200177  normal  0.351025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3860  alpha amylase, catalytic region  32.19 
 
 		 695 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  32.37 
 
 		 1144 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3934  alpha amylase, catalytic region  32.19 
 
 		 695 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.538651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3846  alpha amylase, catalytic region  32.19 
 
 		 695 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0237577 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  30.5 
 
 		 1130 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2030  alpha amylase domain-containing protein  34.48 
 
 		 672 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.219861  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  31.39 
 
 		 1022 aa  58.2  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0829  Alpha amylase, catalytic region  30.53 
 
 		 662 aa  58.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.673433  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  34.13 
 
 		 816 aa  58.2  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0135  alpha amylase catalytic region  33.62 
 
 		 660 aa  58.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2295  alpha amylase, catalytic region  29.93 
 
 		 660 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0369553  hitchhiker  0.000002386 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1190  trehalose-6-phosphate hydrolase  34.21 
 
 		 746 aa  57.8  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0210  alpha amylase catalytic region  33.05 
 
 		 676 aa  57.4  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1984  alpha amylase domain-containing protein  34.78 
 
 		 671 aa  57.4  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3678  alpha amylase, catalytic region  33.59 
 
 		 672 aa  57.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.763851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1052  alpha amylase catalytic region  32.24 
 
 		 672 aa  57.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0679  alpha amylase, catalytic region  34.78 
 
 		 653 aa  57.4  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2858  alpha amylase catalytic region  32.19 
 
 		 681 aa  57  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1209  alpha amylase, catalytic region  32.76 
 
 		 657 aa  57  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  29.17 
 
 		 1148 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1815  alpha amylase catalytic region  29.93 
 
 		 672 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.474679  normal  0.202822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19040  glycosidase  34.78 
 
 		 675 aa  56.6  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.000683856  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  30.66 
 
 		 708 aa  56.6  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0249  alpha amylase catalytic region  34.33 
 
 		 656 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.852341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1809  alpha amylase, catalytic region  36.15 
 
 		 670 aa  57  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341723  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  29.17 
 
 		 1136 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  31.06 
 
 		 483 aa  57  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  29.17 
 
 		 1115 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  29.17 
 
 		 1115 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  29.17 
 
 		 1115 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3071  alpha amylase catalytic region  33.04 
 
 		 674 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224313  normal  0.685148 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  29.93 
 
 		 1131 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  31.39 
 
 		 688 aa  56.2  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1884  alpha amylase, catalytic region  31.9 
 
 		 684 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0153  alpha amylase catalytic region  31.03 
 
 		 652 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4301  alpha amylase, catalytic region  31.51 
 
 		 696 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844806 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  29.17 
 
 		 1115 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0116  alpha amylase catalytic region  31.9 
 
 		 660 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0759289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2344  alpha amylase, catalytic region  31.47 
 
 		 696 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969175  normal  0.43625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  30.94 
 
 		 672 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  30.94 
 
 		 672 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  33.33 
 
 		 724 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3678  alpha amylase, catalytic region  31.9 
 
 		 659 aa  55.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>