More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1284 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1284  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  471  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2510  GntR domain protein  32.55 
 
 		 240 aa  104  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.243231  normal  0.021111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  30.57 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  30.94 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  33.57 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  27.57 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  32.65 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  35.66 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  28.72 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  27.96 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1232  GntR-like  29.59 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6600  GntR domain-containing protein  29.59 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  normal  0.274665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  33.33 
 
 		 249 aa  68.2  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4197  GntR domain protein  29.84 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  31.82 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  32.21 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  30.23 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  28.11 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  30 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  25.24 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  32.41 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  29.13 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  23.32 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  30.16 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  25.96 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  26.24 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  30.26 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  29.19 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  29.58 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  27.75 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  27.78 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  27.16 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  26.56 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0666  regulatory protein GntR HTH  28.7 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  27.08 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  24.62 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  27.08 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  27.08 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  27.08 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  30.14 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5046  GntR domain protein  32.82 
 
 		 240 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0660  regulatory protein GntR, HTH  28.7 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.519359  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  28.5 
 
 		 287 aa  62  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  29.87 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  31.82 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  26.56 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  33.1 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0750  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33475  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  28.35 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  30.36 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  27.23 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  24.5 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  27.08 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  26.24 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  26.03 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  27.08 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  27.08 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  27.03 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  26.04 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  27.08 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  26.24 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  26.24 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  29.65 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  28.36 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  29.65 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3331  Uxu operon transcriptional regulator  29.65 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  26.04 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  29.65 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4102  GntR domain protein  27.73 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  27.62 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  26.04 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  28.84 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  28.37 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  33.59 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  32.19 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  26.15 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  26.44 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  28.35 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  27.08 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  30.19 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  26.04 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>