More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2510 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2510  GntR domain protein  100 
 
 		 240 aa  475  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.243231  normal  0.021111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1284  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  30.43 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  33.68 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3125  GntR domain-containing protein  32.85 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.52 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1885  GntR domain-containing protein  34.9 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  28.37 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  29.77 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2254  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385472  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3484  GntR domain-containing protein  37.24 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0607093  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  26.76 
 
 		 218 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  26.76 
 
 		 218 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.88 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4879  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  25.71 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  26.76 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  26.98 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1728  GntR domain-containing protein  33.8 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  23.33 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  25.97 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  29.05 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  23.35 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  29.6 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  33.57 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  23.27 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  31.86 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  30.09 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  29 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2675  transcriptional regulator GntR  33.48 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  29.7 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  27.8 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  27.85 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  28.92 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5356  transcriptional regulator GntR family  31.25 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  36.11 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  30.39 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  27.27 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  28.86 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3406  GntR domain protein  28.16 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  29.33 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  30.36 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 232 aa  62  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  29.77 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  28.78 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  31.1 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.29 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4351  GntR domain-containing protein  28.31 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4102  GntR domain protein  31.9 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  34.62 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  32.37 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  28.05 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  30.96 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3340  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.5 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2015  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215087  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  31.73 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0212  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  28.29 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4649  GntR domain protein  30.35 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  30.05 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  27.1 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  29.75 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  27.75 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  32.59 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  33.13 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  29.86 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  30.85 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  29.38 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0260  GntR domain-containing protein  28.22 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>