More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2609 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2609  pseudouridine synthase  100 
 
 		 237 aa  479  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000148831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2431  pseudouridine synthase  51.13 
 
 		 223 aa  218  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0278  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  50.44 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0461  pseudouridine synthase  47.37 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0345  pseudouridine synthase  44.02 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3776  pseudouridine synthase  46.88 
 
 		 243 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4712  pseudouridine synthase  46.05 
 
 		 229 aa  177  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1153  pseudouridine synthase  42.73 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00899348  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0405  pseudouridine synthase  40.45 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4400  pseudouridine synthase  47.19 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2721  pseudouridine synthase  42.29 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0403839  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0631  pseudouridine synthase  38.2 
 
 		 269 aa  160  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0707  pseudouridine synthase  41.26 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3219  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.48 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1191  pseudouridine synthase  40.45 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.8752  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10688  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  44.05 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1533  pseudouridine synthase  42.13 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1041  pseudouridine synthase  36.84 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  34.67 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1884  pseudouridine synthase, RluA family  34.62 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0958449  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3480  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.09 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0583016 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  34.67 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.77 
 
 		 303 aa  116  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2086  pseudouridine synthase, RluA family  33.76 
 
 		 330 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.140778  normal  0.342789 
 
 
-
 
NC_002978  WD1162  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.52 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0658766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1843  pseudouridine synthase  36.6 
 
 		 238 aa  114  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0492  pseudouridine synthase, RluA family  33.49 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1019  RluA family pseudouridine synthase  32.75 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.798058 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3766  ribosomal pseudouridine synthase C, large subunit  33.03 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2370  pseudouridine synthase  36.7 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1394  pseudouridine synthase, RluD  32.03 
 
 		 412 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.377241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0730  RluA family pseudouridine synthase  35.89 
 
 		 327 aa  111  9e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0504919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1413  pseudouridine synthase, RluA family  35.75 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0119542  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08006  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.64 
 
 		 356 aa  110  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1000  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.62 
 
 		 326 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0657  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.04 
 
 		 320 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2710  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.35 
 
 		 368 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1598  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.06 
 
 		 334 aa  109  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5034  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.9 
 
 		 458 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1651  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.2 
 
 		 347 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0391  RluA family pseudouridine synthase  30.93 
 
 		 346 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2083  RluA family pseudouridine synthase  34.06 
 
 		 326 aa  108  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0966  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.19 
 
 		 318 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.948591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1878  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  31.98 
 
 		 301 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000421798  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  35.56 
 
 		 305 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0790  RluA family pseudouridine synthase  30.51 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.143813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0540  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.29 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.373783  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1777  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.42 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00553261  decreased coverage  0.000101871 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2261  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.03 
 
 		 330 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4767  RluA family pseudouridine synthase  33.33 
 
 		 364 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305838  hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3403  pseudouridine synthase RluD  31.6 
 
 		 501 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0666836  normal  0.0916306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1648  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.33 
 
 		 327 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.141846  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2505  RluA family pseudouridine synthase  30.51 
 
 		 346 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3129  pseudouridine synthase RluD  31.67 
 
 		 444 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411663  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  33.33 
 
 		 304 aa  104  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1520  pseudouridine synthase, RluA family  34.91 
 
 		 308 aa  105  9e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1745  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.51 
 
 		 346 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0278  RluA family pseudouridine synthase  29.18 
 
 		 468 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3624  pseudouridine synthase, RluA family  30.74 
 
 		 455 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0322  pseudouridine synthase, RluA family  29.18 
 
 		 468 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.539792  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2335  pseudouridine synthase RluD  30.74 
 
 		 453 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.134936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1575  pseudouridine synthase, RluD  30.74 
 
 		 411 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286446  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0553  pseudouridine synthase, RluA family  30.99 
 
 		 352 aa  103  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1649  RluA family pseudouridine synthase  36.77 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0624  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.93 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1237  RluA family pseudouridine synthase  31.82 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289539  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0354  pseudouridine synthase, RluA family  28.76 
 
 		 446 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6367  RluA family pseudouridine synthase  29.61 
 
 		 469 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129788  normal  0.347421 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0486  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  33.62 
 
 		 337 aa  102  6e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.766955  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3518  pseudouridine synthase, RluA family  29.95 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  30.18 
 
 		 560 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0663  RluA family pseudouridine synthase  29.17 
 
 		 352 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241862  normal  0.120069 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0337  RluA family pseudouridine synthase  36.94 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0186274  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7124  pseudouridine synthase, RluA family  29.18 
 
 		 457 aa  101  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0584  RluA family pseudouridine synthase  35.45 
 
 		 298 aa  101  9e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.460121  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0669  RluA family pseudouridine synthase  29.17 
 
 		 352 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1440  pseudouridine synthase, RluA family  31.65 
 
 		 347 aa  101  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.738263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0291  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.1 
 
 		 348 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3146  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.69 
 
 		 343 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19664  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1654  pseudouridine synthase  29.81 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.142786 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1373  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.47 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.08 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5281  RluA family pseudouridine synthase  31.28 
 
 		 362 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0773013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2578  pseudouridine synthase, RluA family  31.76 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1196  pseudouridine synthase, RluA family  34.67 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1214  pseudouridine synthase  29.75 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262969  normal  0.0773079 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  31.56 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2551  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.63 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.682293  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1491  pseudouridine synthase, RluA family protein  31.96 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1100  pseudouridine synthase, RluA family  40 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02221  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  34.96 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.135305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2613  RluA family pseudouridine synthase  31.82 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1560  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  34.09 
 
 		 326 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2837  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.05 
 
 		 436 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0449259  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0604  pseudouridine synthase, RluD  29.41 
 
 		 341 aa  99.8  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.206987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0857  RluA family pseudouridine synthase  28.57 
 
 		 471 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1041  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C protein  31.84 
 
 		 331 aa  99.4  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.017285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02691  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  33.64 
 
 		 326 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02131  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  32.74 
 
 		 319 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1658  RluA family pseudouridine synthase  32.2 
 
 		 329 aa  99  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.615207  normal  0.0770781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>