More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0966 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1000  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  99.06 
 
 
326 aa  649    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0966  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  100 
 
 
318 aa  655    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.948591  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2083  RluA family pseudouridine synthase  92.45 
 
 
326 aa  624  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1019  RluA family pseudouridine synthase  75.94 
 
 
330 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.798058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1648  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  76.1 
 
 
327 aa  512  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.141846  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0730  RluA family pseudouridine synthase  71.29 
 
 
327 aa  502  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0504919  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1884  pseudouridine synthase, RluA family  73.82 
 
 
329 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0958449  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2261  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  74.2 
 
 
330 aa  494  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2086  pseudouridine synthase, RluA family  73.25 
 
 
330 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.140778  normal  0.342789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3403  pseudouridine synthase RluD  55.13 
 
 
501 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0666836  normal  0.0916306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3624  pseudouridine synthase, RluA family  55.87 
 
 
455 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2335  pseudouridine synthase RluD  55.87 
 
 
453 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.134936 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1394  pseudouridine synthase, RluD  54.13 
 
 
412 aa  368  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.377241  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5034  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  54.91 
 
 
458 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3129  pseudouridine synthase RluD  55.24 
 
 
444 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411663  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1575  pseudouridine synthase, RluD  55.05 
 
 
411 aa  368  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286446  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0278  RluA family pseudouridine synthase  55.1 
 
 
468 aa  368  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0322  pseudouridine synthase, RluA family  55.1 
 
 
468 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.539792  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4767  RluA family pseudouridine synthase  53.06 
 
 
364 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305838  hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6367  RluA family pseudouridine synthase  55.48 
 
 
469 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129788  normal  0.347421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7124  pseudouridine synthase, RluA family  56.13 
 
 
457 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0354  pseudouridine synthase, RluA family  54.84 
 
 
446 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115819  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0857  RluA family pseudouridine synthase  54.52 
 
 
471 aa  360  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295039 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1312  RluA family pseudouridine synthase  51.04 
 
 
350 aa  333  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0090  pseudouridine synthase, RluA family  49.54 
 
 
349 aa  322  6e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.768556 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2837  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  47.98 
 
 
436 aa  290  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0449259  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2767  RluA family pseudouridine synthase  49.84 
 
 
330 aa  287  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.901259 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0291  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  45.32 
 
 
348 aa  282  5.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2659  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  47 
 
 
330 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0492  pseudouridine synthase, RluA family  46.75 
 
 
325 aa  272  7e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113875 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0164  RluA family pseudouridine synthase  48.08 
 
 
324 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0315  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  46.22 
 
 
348 aa  259  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.458148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1658  RluA family pseudouridine synthase  44.69 
 
 
329 aa  258  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.615207  normal  0.0770781 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2505  RluA family pseudouridine synthase  43.15 
 
 
346 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1745  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  42.86 
 
 
346 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1763  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  41.67 
 
 
330 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.397176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2710  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  42.09 
 
 
368 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2102  pseudouridine synthase, RluD  44.16 
 
 
405 aa  249  5e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0391  RluA family pseudouridine synthase  42.56 
 
 
346 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0624  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  43.21 
 
 
354 aa  248  7e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0790  RluA family pseudouridine synthase  42.9 
 
 
348 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.143813  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0415  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C, putative  36.93 
 
 
307 aa  202  6e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1721  pseudouridine synthase, RluD  38.44 
 
 
346 aa  189  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1174  RluA family pseudouridine synthase  37.7 
 
 
399 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539633  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0714  23S rRNA pseudouridylate synthase C  35.78 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1479  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.93 
 
 
316 aa  179  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352781  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  37.16 
 
 
318 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1620  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.61 
 
 
332 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00181118  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5281  RluA family pseudouridine synthase  37.78 
 
 
362 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0773013  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25580  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.82 
 
 
318 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050794  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2001  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.08 
 
 
319 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000244921  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1284  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.08 
 
 
319 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0174547  hitchhiker  0.00000000220374 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1299  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.08 
 
 
319 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.547954  hitchhiker  0.000000178257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1255  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.08 
 
 
319 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0242253  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2185  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.08 
 
 
319 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.012302  hitchhiker  0.000000000136846 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02339  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C (pseudouridylate synthase) (uracil hydrolyase  36.94 
 
 
313 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.336245  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1379  pseudouridine synthase, RluA family  36.88 
 
 
370 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2033  RluA family pseudouridine synthase  35.46 
 
 
319 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.904373  normal  0.0708013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3840  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35.47 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.283554  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2041  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.16 
 
 
319 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000773418  hitchhiker  0.000351853 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01082  23S rRNA pseudouridylate synthase  36.16 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000778536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2561  pseudouridine synthase, RluA family  36.16 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000499668  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1464  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.16 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000220754  hitchhiker  0.00000000172116 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1639  pseudouridine synthase, RluD  35.47 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.289887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1482  RluA family pseudouridine synthase  36.15 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286389  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3808  RluA family pseudouridine synthase  36.15 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0127606  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1208  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.16 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1208  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.16 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.7217399999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01090  hypothetical protein  36.16 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000557514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1517  RluA family pseudouridine synthase  35.59 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000147946  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2515  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.16 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000444551  hitchhiker  0.0000916413 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1616  pseudouridine synthase, RluA family  33.87 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2633  lysozyme  35.35 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4165  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35.25 
 
 
320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0336491  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1614  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.31 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109224  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2239  23S rRNA pseudouridylate synthase C  35.83 
 
 
319 aa  172  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000198156  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1777  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  38.31 
 
 
328 aa  172  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00553261  decreased coverage  0.000101871 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2642  pseudouridine synthase, RluA family  36.79 
 
 
339 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704369  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4787  RluA family pseudouridine synthase  38.12 
 
 
334 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2815  23S rRNA pseudouridylate synthase C  34.6 
 
 
318 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000464709  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1601  23S rRNA pseudouridylate synthase C  34.94 
 
 
315 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000249423  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3659  pseudouridine synthase, RluD  35.01 
 
 
378 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002989  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  34.85 
 
 
314 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2214  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  34.98 
 
 
315 aa  169  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2242  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  34.98 
 
 
315 aa  169  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0704  pseudouridine synthase, RluD  35.43 
 
 
312 aa  169  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1875  RluA family pseudouridine synthase  34.47 
 
 
317 aa  169  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.763374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14830  Pseudouridine synthase, RluC  35.76 
 
 
278 aa  168  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.300608  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1580  pseudouridine synthase, RluA family  33.87 
 
 
319 aa  168  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000241554  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1041  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C protein  37.18 
 
 
331 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.017285  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1594  RluA family pseudouridine synthase  35.24 
 
 
329 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260553  normal  0.0130241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2303  RluA family pseudouridine synthase  35.19 
 
 
323 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0971  pseudouridine synthase, RluA family  37.58 
 
 
344 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.158596 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2510  23S rRNA pseudouridylate synthase C  34.54 
 
 
318 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0906  pseudouridine synthase, RluA family  37.58 
 
 
344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447686  normal  0.0333397 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02917  rRNA ribosomal pseudouridine synthase  34.65 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01518  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35.96 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0480  RluA family pseudouridine synthase  33 
 
 
364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.632369  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1429  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  38.26 
 
 
327 aa  166  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.550632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3085  RluA family pseudouridine synthase  36.14 
 
 
398 aa  165  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>