120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2323 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3032  RocB protein  78.02 
 
 
546 aa  927    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00171175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2784  RocB protein  78.75 
 
 
546 aa  933    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.123393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2733  M20 family peptidase  78.94 
 
 
546 aa  933    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2714  M20 family peptidase  78.21 
 
 
546 aa  924    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.511155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2996  RocB protein  78.75 
 
 
546 aa  933    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205778  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3377  peptidase M20  59.29 
 
 
539 aa  705    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2323  peptidase M20  100 
 
 
546 aa  1132    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000106298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3028  peptidase M20  79.82 
 
 
546 aa  943    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.526527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3030  RocB protein  78.57 
 
 
546 aa  929    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2996  RocB protein  78.35 
 
 
546 aa  926    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00165628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2249  RocB protein  78.72 
 
 
546 aa  931    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00011132  hitchhiker  0.000447165 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2994  RocB protein  78.72 
 
 
546 aa  928    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000537344 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2784  peptidase M20  35.71 
 
 
555 aa  352  8.999999999999999e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520894  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2792  peptidase M20  35.29 
 
 
558 aa  338  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1394  peptidase M20  30.91 
 
 
533 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0034  peptidase M20  30.47 
 
 
530 aa  244  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.917037  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0929  peptidase M20  32.59 
 
 
543 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165198  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3500  peptidase M20  28.86 
 
 
551 aa  217  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4285  peptidase M20  28.39 
 
 
605 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194958  normal  0.944988 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0950  arginine utilization protein RocB  29.77 
 
 
536 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2610  peptidase M20  29.58 
 
 
536 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.25 
 
 
395 aa  65.1  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0078  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.27 
 
 
397 aa  60.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1499  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.27 
 
 
441 aa  59.3  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1031  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.38 
 
 
395 aa  58.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0972  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.38 
 
 
395 aa  58.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1633  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.69 
 
 
403 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.73321  normal  0.191724 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 
426 aa  57.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.250429  normal  0.531249 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.56 
 
 
433 aa  57.4  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1338  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.16 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1080  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.72 
 
 
375 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.78 
 
 
397 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2607  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.84 
 
 
382 aa  54.7  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  22.51 
 
 
401 aa  55.1  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1601  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.76 
 
 
387 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0549352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.96 
 
 
377 aa  53.5  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1915  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.42 
 
 
388 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.43 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.23 
 
 
402 aa  53.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0474  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.94 
 
 
404 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.06 
 
 
389 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0077  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 
388 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0144823 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1722  acetylornithine deacetylase  25.54 
 
 
433 aa  52.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.633386  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.07 
 
 
395 aa  51.6  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0628  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.39 
 
 
387 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0549  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.5 
 
 
407 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  23.76 
 
 
400 aa  51.6  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01145  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.57 
 
 
376 aa  51.2  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0346694  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  22.44 
 
 
385 aa  50.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0642  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.29 
 
 
402 aa  50.8  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.39661  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.82 
 
 
402 aa  50.4  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.51 
 
 
398 aa  50.1  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.5 
 
 
380 aa  50.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  23.85 
 
 
406 aa  49.7  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.34 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2048  acetylornithine deacetylase  30.08 
 
 
418 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.32 
 
 
414 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.31 
 
 
363 aa  49.7  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.6 
 
 
375 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3149  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.1 
 
 
392 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.03 
 
 
398 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.65 
 
 
399 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  22.99 
 
 
409 aa  48.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1610  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.88 
 
 
447 aa  48.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  25.22 
 
 
457 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.53 
 
 
375 aa  47.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  27.46 
 
 
384 aa  47.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12180  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  25.6 
 
 
463 aa  47.8  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0246803  normal  0.255441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2875  acetylornithine deacetylase  25.36 
 
 
427 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1523  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.91 
 
 
383 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3162  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.62 
 
 
375 aa  47  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.25 
 
 
375 aa  47  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.92 
 
 
391 aa  46.6  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0144  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.12 
 
 
381 aa  47  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.131428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0809  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.25 
 
 
392 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1255  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.47 
 
 
375 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.9 
 
 
395 aa  47  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2996  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.04 
 
 
381 aa  46.2  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.21 
 
 
377 aa  46.2  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.1 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1804  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.51 
 
 
386 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0689482  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.47 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.9 
 
 
375 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1823  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.13 
 
 
369 aa  45.8  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.248504  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3141  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.47 
 
 
375 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1372  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.47 
 
 
375 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.59 
 
 
356 aa  45.8  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.11 
 
 
410 aa  45.4  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0918  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.63 
 
 
377 aa  45.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  26.54 
 
 
384 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.46 
 
 
366 aa  45.1  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.25 
 
 
391 aa  45.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0048  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.04 
 
 
380 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0948  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.3 
 
 
377 aa  45.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7333  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.5 
 
 
384 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3737  acetylornithine deacetylase  24.09 
 
 
427 aa  44.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24 
 
 
375 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2742  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24 
 
 
375 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2716  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24 
 
 
375 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0930351 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24 
 
 
375 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>