54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0950 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2610  peptidase M20  99.07 
 
 		 536 aa  1026    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0950  arginine utilization protein RocB  100 
 
 		 536 aa  1038    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3500  peptidase M20  39.71 
 
 		 551 aa  317  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0034  peptidase M20  41.37 
 
 		 530 aa  302  9e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.917037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4285  peptidase M20  38.87 
 
 		 605 aa  257  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194958  normal  0.944988 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2784  peptidase M20  26.76 
 
 		 555 aa  203  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1394  peptidase M20  31.05 
 
 		 533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2323  peptidase M20  29.77 
 
 		 546 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000106298  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3377  peptidase M20  29.81 
 
 		 539 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2792  peptidase M20  27.49 
 
 		 558 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2714  M20 family peptidase  27.58 
 
 		 546 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.511155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3028  peptidase M20  28.09 
 
 		 546 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.526527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3030  RocB protein  27.58 
 
 		 546 aa  174  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2733  M20 family peptidase  27.12 
 
 		 546 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2996  RocB protein  27.39 
 
 		 546 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205778  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2996  RocB protein  27.22 
 
 		 546 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00165628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2784  RocB protein  27.39 
 
 		 546 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.123393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2994  RocB protein  27.58 
 
 		 546 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000537344 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2249  RocB protein  26.69 
 
 		 546 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00011132  hitchhiker  0.000447165 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3032  RocB protein  28 
 
 		 546 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00171175  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0929  peptidase M20  32.26 
 
 		 543 aa  147  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165198  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  34.18 
 
 		 392 aa  53.9  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  31.31 
 
 		 434 aa  50.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0081  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.21 
 
 		 377 aa  50.4  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0077  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.2 
 
 		 388 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0144823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0628  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 		 387 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0557  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.97 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  31.77 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01145  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.52 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0346694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  26.63 
 
 		 382 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1333  diaminopimelate aminotransferase  32.12 
 
 		 407 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.71 
 
 		 397 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  31.71 
 
 		 377 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  36.22 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  31.71 
 
 		 377 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.91 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.54 
 
 		 363 aa  44.7  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.46 
 
 		 375 aa  44.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2664  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.33 
 
 		 427 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.18198 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.06 
 
 		 375 aa  45.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1601  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.19 
 
 		 387 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0549352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.11 
 
 		 375 aa  44.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.51 
 
 		 396 aa  44.3  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0095  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.07 
 
 		 377 aa  44.3  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1724  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.05 
 
 		 377 aa  44.3  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02089  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.84 
 
 		 390 aa  44.3  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.569859  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1080  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.97 
 
 		 375 aa  44.3  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3162  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.77 
 
 		 375 aa  44.3  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1734  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.78 
 
 		 377 aa  44.3  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.21 
 
 		 377 aa  43.9  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0549  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.68 
 
 		 407 aa  43.5  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  33.62 
 
 		 418 aa  43.5  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  35.25 
 
 		 411 aa  43.5  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0810  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  34.05 
 
 		 447 aa  43.5  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.966412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>