122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3377 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_2994  RocB protein  59.4 
 
 		 546 aa  697    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000537344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3032  RocB protein  59.59 
 
 		 546 aa  702    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00171175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2784  RocB protein  59.22 
 
 		 546 aa  698    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.123393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2733  M20 family peptidase  59.4 
 
 		 546 aa  699    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2714  M20 family peptidase  60.15 
 
 		 546 aa  700    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.511155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2996  RocB protein  59.22 
 
 		 546 aa  698    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205778  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3377  peptidase M20  100 
 
 		 539 aa  1121    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2323  peptidase M20  59.29 
 
 		 546 aa  705    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000106298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3028  peptidase M20  58.47 
 
 		 546 aa  696    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.526527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3030  RocB protein  59.4 
 
 		 546 aa  697    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2996  RocB protein  59.22 
 
 		 546 aa  694    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00165628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2249  RocB protein  59.59 
 
 		 546 aa  701    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00011132  hitchhiker  0.000447165 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2784  peptidase M20  40.18 
 
 		 555 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2792  peptidase M20  39.21 
 
 		 558 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1394  peptidase M20  32.33 
 
 		 533 aa  274  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0034  peptidase M20  33.46 
 
 		 530 aa  263  4.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.917037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3500  peptidase M20  31.07 
 
 		 551 aa  239  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0929  peptidase M20  31.55 
 
 		 543 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165198  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4285  peptidase M20  27.71 
 
 		 605 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194958  normal  0.944988 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2610  peptidase M20  28.22 
 
 		 536 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0950  arginine utilization protein RocB  28.22 
 
 		 536 aa  150  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1722  acetylornithine deacetylase  27.43 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.633386  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1499  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.43 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.1 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.51 
 
 		 395 aa  55.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0077  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.19 
 
 		 388 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0144823 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  26.46 
 
 		 386 aa  54.3  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  27.56 
 
 		 385 aa  53.9  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.08 
 
 		 426 aa  53.9  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.250429  normal  0.531249 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1031  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.19 
 
 		 395 aa  53.5  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0972  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.19 
 
 		 395 aa  53.5  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2048  acetylornithine deacetylase  30.16 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2607  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.98 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0809  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.66 
 
 		 392 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  23.51 
 
 		 422 aa  52  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  25.41 
 
 		 422 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.98 
 
 		 402 aa  51.2  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  25.41 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0078  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.95 
 
 		 397 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.27 
 
 		 375 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2742  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.27 
 
 		 375 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2716  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.27 
 
 		 375 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0930351 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2849  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.27 
 
 		 375 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  25.27 
 
 		 422 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  37.4 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.27 
 
 		 375 aa  50.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.19 
 
 		 398 aa  50.4  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  24.86 
 
 		 422 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  24.86 
 
 		 422 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0948  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  24.86 
 
 		 422 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  24.86 
 
 		 422 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3347  acetylornithine deacetylase  21.85 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  23.02 
 
 		 422 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  25.41 
 
 		 422 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  24.86 
 
 		 422 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.55 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  25.51 
 
 		 468 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1601  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.92 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0549352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2875  acetylornithine deacetylase  24.14 
 
 		 427 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0642  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.82 
 
 		 402 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.39661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0628  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.32 
 
 		 387 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1080  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.91 
 
 		 375 aa  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 395 aa  48.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.56 
 
 		 375 aa  48.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1633  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.88 
 
 		 403 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.73321  normal  0.191724 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.64 
 
 		 399 aa  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3162  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.02 
 
 		 375 aa  47.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.42 
 
 		 375 aa  47.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.1 
 
 		 381 aa  47.8  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  35.77 
 
 		 436 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.18 
 
 		 375 aa  47.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.21 
 
 		 397 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0918  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.6 
 
 		 377 aa  47  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.96 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.72 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  27.08 
 
 		 403 aa  47  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.16 
 
 		 375 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2664  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.07 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.18198 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.81 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 389 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  25.21 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  25.22 
 
 		 392 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.48 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1445  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.34 
 
 		 365 aa  45.1  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0181667  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0144  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.37 
 
 		 381 aa  45.1  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.131428  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0549  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.41 
 
 		 407 aa  45.4  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  33.33 
 
 		 438 aa  45.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  24.8 
 
 		 389 aa  45.4  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0561  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.4 
 
 		 407 aa  44.7  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0354  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.55 
 
 		 388 aa  45.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  26.4 
 
 		 400 aa  44.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.7 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.15 
 
 		 363 aa  45.1  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3737  acetylornithine deacetylase  22.81 
 
 		 427 aa  44.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3068  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.22 
 
 		 389 aa  44.3  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.76584  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.77 
 
 		 407 aa  44.3  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  36.36 
 
 		 372 aa  44.3  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3693  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.35 
 
 		 375 aa  44.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>