127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0929 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0929  peptidase M20  100 
 
 		 543 aa  1090    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2249  RocB protein  34.97 
 
 		 546 aa  261  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00011132  hitchhiker  0.000447165 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2733  M20 family peptidase  34.97 
 
 		 546 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2784  RocB protein  35.28 
 
 		 546 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.123393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2996  RocB protein  35.28 
 
 		 546 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205778  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3030  RocB protein  35.4 
 
 		 546 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2994  RocB protein  35.51 
 
 		 546 aa  256  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000537344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3032  RocB protein  34.64 
 
 		 546 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00171175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2996  RocB protein  34.61 
 
 		 546 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00165628  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2714  M20 family peptidase  35.4 
 
 		 546 aa  253  7e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.511155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2784  peptidase M20  31.26 
 
 		 555 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3028  peptidase M20  34.21 
 
 		 546 aa  249  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.526527  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2323  peptidase M20  32.59 
 
 		 546 aa  239  8e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000106298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2792  peptidase M20  32.12 
 
 		 558 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3377  peptidase M20  31.55 
 
 		 539 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106714  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0034  peptidase M20  34.96 
 
 		 530 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.917037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1394  peptidase M20  30.39 
 
 		 533 aa  193  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3500  peptidase M20  31.22 
 
 		 551 aa  190  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4285  peptidase M20  29.87 
 
 		 605 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194958  normal  0.944988 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2610  peptidase M20  30.34 
 
 		 536 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0950  arginine utilization protein RocB  30.56 
 
 		 536 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1291  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.69 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0561  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.09 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0549  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.21 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  25.77 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.11 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  29.29 
 
 		 362 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0095  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.23 
 
 		 377 aa  55.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  24.84 
 
 		 384 aa  55.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2044  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.02 
 
 		 391 aa  55.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.44 
 
 		 391 aa  55.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01145  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.94 
 
 		 376 aa  55.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0346694  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.36 
 
 		 375 aa  55.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0081  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.27 
 
 		 377 aa  54.7  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.47 
 
 		 378 aa  54.3  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.45 
 
 		 374 aa  53.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.438306  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0781  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.45 
 
 		 374 aa  53.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.946099  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.73 
 
 		 391 aa  53.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3162  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.32 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.3 
 
 		 376 aa  52.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  28.81 
 
 		 400 aa  52  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0277  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.14 
 
 		 401 aa  51.2  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2196  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.94 
 
 		 385 aa  51.2  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1633  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.01 
 
 		 403 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.73321  normal  0.191724 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.27 
 
 		 433 aa  50.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.32 
 
 		 375 aa  50.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1852  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 378 aa  50.4  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.751172  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  25.3 
 
 		 403 aa  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  24.5 
 
 		 384 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.61 
 
 		 402 aa  50.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1420  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.78 
 
 		 383 aa  50.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000737808  normal  0.0270135 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.4 
 
 		 377 aa  50.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  26.03 
 
 		 382 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0411  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.86 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  22.32 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  28.4 
 
 		 365 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1523  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.87 
 
 		 383 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1601  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.41 
 
 		 387 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0549352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1915  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.11 
 
 		 388 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.73 
 
 		 375 aa  48.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.65 
 
 		 383 aa  48.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0628  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.25 
 
 		 387 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0077  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.64 
 
 		 388 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0144823 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0642  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.26 
 
 		 402 aa  47.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.39661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2875  acetylornithine deacetylase  25.19 
 
 		 427 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1271  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.56 
 
 		 392 aa  47.4  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.15 
 
 		 375 aa  47.4  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.38 
 
 		 383 aa  47.4  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1724  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.96 
 
 		 377 aa  47.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.51 
 
 		 399 aa  47  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  27.48 
 
 		 410 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  31.69 
 
 		 378 aa  47  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3336  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.52 
 
 		 383 aa  47  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0627884 
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.05 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.32 
 
 		 382 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0918  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.41 
 
 		 377 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1994  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.49 
 
 		 425 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  25.37 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.76 
 
 		 377 aa  47  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.61 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  21.84 
 
 		 390 aa  47  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  26.9 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3737  acetylornithine deacetylase  24.54 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02089  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.87 
 
 		 390 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.569859  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.32 
 
 		 382 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0948  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.41 
 
 		 377 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1810  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.88 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.834903 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.98 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.98 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3149  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.99 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3697  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.66 
 
 		 411 aa  45.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891893  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4562  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.56 
 
 		 388 aa  45.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.47 
 
 		 414 aa  44.7  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.12 
 
 		 395 aa  44.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1804  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.62 
 
 		 386 aa  45.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0689482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.19 
 
 		 383 aa  45.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6045  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.05 
 
 		 379 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.790399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2032  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.05 
 
 		 379 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460385  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.63 
 
 		 395 aa  44.7  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  26.35 
 
 		 389 aa  44.3  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>