168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_2996 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3032  RocB protein  96.15 
 
 		 546 aa  1094    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00171175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2784  RocB protein  100 
 
 		 546 aa  1132    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.123393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2733  M20 family peptidase  99.63 
 
 		 546 aa  1128    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2714  M20 family peptidase  97.62 
 
 		 546 aa  1107    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.511155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3030  RocB protein  97.62 
 
 		 546 aa  1108    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2996  RocB protein  100 
 
 		 546 aa  1132    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205778  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2994  RocB protein  99.27 
 
 		 546 aa  1125    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000537344 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3377  peptidase M20  59.22 
 
 		 539 aa  698    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2996  RocB protein  94.86 
 
 		 546 aa  1072    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00165628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2249  RocB protein  95.96 
 
 		 546 aa  1082    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00011132  hitchhiker  0.000447165 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2323  peptidase M20  78.75 
 
 		 546 aa  933    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000106298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3028  peptidase M20  94.68 
 
 		 546 aa  1081    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.526527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2784  peptidase M20  38.19 
 
 		 555 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2792  peptidase M20  37.04 
 
 		 558 aa  344  2.9999999999999997e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1394  peptidase M20  31.47 
 
 		 533 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0929  peptidase M20  35.28 
 
 		 543 aa  238  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0034  peptidase M20  31.02 
 
 		 530 aa  236  8e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.917037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3500  peptidase M20  27.27 
 
 		 551 aa  205  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4285  peptidase M20  29.01 
 
 		 605 aa  174  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194958  normal  0.944988 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2610  peptidase M20  28.05 
 
 		 536 aa  134  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0950  arginine utilization protein RocB  27.5 
 
 		 536 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1499  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.57 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1722  acetylornithine deacetylase  29.44 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.633386  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1080  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.42 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.92 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.29 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.19 
 
 		 375 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1633  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.4 
 
 		 403 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.73321  normal  0.191724 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01145  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.41 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0346694  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.68 
 
 		 389 aa  55.1  0.000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1523  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.71 
 
 		 383 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3162  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.19 
 
 		 375 aa  54.7  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2607  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.71 
 
 		 382 aa  54.7  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.21 
 
 		 381 aa  54.7  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.84 
 
 		 391 aa  53.9  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.65 
 
 		 402 aa  53.5  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.56 
 
 		 375 aa  53.5  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1601  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.69 
 
 		 387 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0549352 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0144  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.22 
 
 		 381 aa  53.5  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.131428  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1804  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.17 
 
 		 386 aa  53.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0689482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1255  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.07 
 
 		 375 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.84 
 
 		 391 aa  53.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1338  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.72 
 
 		 390 aa  52.8  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  24.06 
 
 		 406 aa  52.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1915  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.13 
 
 		 388 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1372  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.07 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3141  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.07 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.51 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.59 
 
 		 398 aa  52  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0077  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 388 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0144823 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.07 
 
 		 387 aa  52  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3149  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.01 
 
 		 392 aa  52  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.1 
 
 		 380 aa  51.6  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0549  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.09 
 
 		 407 aa  51.2  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  25.64 
 
 		 409 aa  50.8  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2048  acetylornithine deacetylase  29.23 
 
 		 418 aa  50.4  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.07 
 
 		 392 aa  50.4  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  25.28 
 
 		 385 aa  50.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1031  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.21 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0561  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.5 
 
 		 407 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.35 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2518  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.43 
 
 		 382 aa  50.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00740773 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0972  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.21 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  25.51 
 
 		 383 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12180  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  25.3 
 
 		 463 aa  49.3  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0246803  normal  0.255441 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.35 
 
 		 375 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1852  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 378 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.751172  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2742  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.35 
 
 		 375 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1869  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.36 
 
 		 375 aa  49.3  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1610  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.84 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2716  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.35 
 
 		 375 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0930351 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0642  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.91 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.39661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  22.19 
 
 		 401 aa  49.3  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.43 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2849  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.35 
 
 		 375 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0631  peptidase M20  27.08 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 375 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1724  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.48 
 
 		 377 aa  48.5  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4745  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.89 
 
 		 410 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0078  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.66 
 
 		 397 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2196  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.36 
 
 		 385 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.99 
 
 		 377 aa  48.9  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0628  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.32 
 
 		 387 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.65 
 
 		 378 aa  48.9  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 386 aa  48.5  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2375  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.14 
 
 		 377 aa  48.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.53 
 
 		 395 aa  48.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.97 
 
 		 391 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.05 
 
 		 405 aa  47.8  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  23.96 
 
 		 422 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.23 
 
 		 375 aa  47.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2875  acetylornithine deacetylase  24.84 
 
 		 427 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 411 aa  47.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.97 
 
 		 391 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4825  acetylornithine deacetylase  24.54 
 
 		 424 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0895557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  26.18 
 
 		 392 aa  47  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  25.74 
 
 		 384 aa  47  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1331  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.03 
 
 		 383 aa  47  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0263045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0810  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 447 aa  47  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.966412 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.48 
 
 		 410 aa  47  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>