188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A2996 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3032  RocB protein  94.31 
 
 
546 aa  1071    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00171175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2994  RocB protein  94.51 
 
 
546 aa  1070    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000537344 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2784  RocB protein  94.86 
 
 
546 aa  1072    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.123393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2733  M20 family peptidase  94.86 
 
 
546 aa  1071    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2714  M20 family peptidase  94.31 
 
 
546 aa  1066    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.511155  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3377  peptidase M20  59.22 
 
 
539 aa  694    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2996  RocB protein  94.86 
 
 
546 aa  1072    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205778  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2249  RocB protein  98.17 
 
 
546 aa  1112    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00011132  hitchhiker  0.000447165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2996  RocB protein  100 
 
 
546 aa  1133    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00165628  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3030  RocB protein  95.05 
 
 
546 aa  1077    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3028  peptidase M20  94.87 
 
 
546 aa  1080    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.526527  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2323  peptidase M20  78.35 
 
 
546 aa  926    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000106298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2784  peptidase M20  38.43 
 
 
555 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520894  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2792  peptidase M20  37.52 
 
 
558 aa  337  3.9999999999999995e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1394  peptidase M20  31.94 
 
 
533 aa  261  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0929  peptidase M20  34.61 
 
 
543 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0034  peptidase M20  30.29 
 
 
530 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.917037  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3500  peptidase M20  26.73 
 
 
551 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4285  peptidase M20  27.59 
 
 
605 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194958  normal  0.944988 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0950  arginine utilization protein RocB  26.65 
 
 
536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2610  peptidase M20  26.83 
 
 
536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1499  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.03 
 
 
441 aa  66.2  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1080  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.54 
 
 
375 aa  63.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1722  acetylornithine deacetylase  25.54 
 
 
433 aa  61.6  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.633386  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1523  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.64 
 
 
383 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.19 
 
 
375 aa  58.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.55 
 
 
402 aa  58.2  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1633  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.12 
 
 
403 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.73321  normal  0.191724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.95 
 
 
395 aa  57  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.22 
 
 
389 aa  55.8  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.69 
 
 
391 aa  56.2  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1338  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.29 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.41 
 
 
377 aa  55.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3162  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.19 
 
 
375 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1601  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.27 
 
 
387 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0549352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.69 
 
 
391 aa  55.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  23.19 
 
 
406 aa  55.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01145  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.08 
 
 
376 aa  55.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0346694  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.7 
 
 
380 aa  55.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2607  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.49 
 
 
382 aa  55.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1804  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.79 
 
 
386 aa  54.7  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0689482  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.09 
 
 
398 aa  54.3  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1255  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.07 
 
 
375 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3149  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.59 
 
 
392 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1915  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.12 
 
 
388 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12180  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  25.7 
 
 
463 aa  53.5  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0246803  normal  0.255441 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2375  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.92 
 
 
377 aa  53.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1372  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.07 
 
 
375 aa  53.5  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0144  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.78 
 
 
381 aa  53.1  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.131428  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3141  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.07 
 
 
375 aa  53.5  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  22.77 
 
 
401 aa  53.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2048  acetylornithine deacetylase  29.2 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1610  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.32 
 
 
447 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.9 
 
 
375 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1331  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.49 
 
 
383 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0263045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  25.27 
 
 
386 aa  52  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.81 
 
 
381 aa  52  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2518  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.43 
 
 
382 aa  51.6  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00740773 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  25 
 
 
383 aa  51.6  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2742  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.85 
 
 
375 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.85 
 
 
375 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2716  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.85 
 
 
375 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0930351 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.85 
 
 
375 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1869  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.36 
 
 
375 aa  51.2  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2849  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.85 
 
 
375 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.59 
 
 
433 aa  51.2  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0549  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.07 
 
 
407 aa  50.8  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.08 
 
 
377 aa  50.8  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  25 
 
 
422 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4745  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.89 
 
 
410 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.91 
 
 
414 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0077  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.12 
 
 
388 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0144823 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.12 
 
 
402 aa  50.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.74 
 
 
391 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  25.28 
 
 
385 aa  50.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0642  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.7 
 
 
402 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.39661  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.44 
 
 
375 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.43 
 
 
383 aa  49.7  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.37 
 
 
391 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  25.28 
 
 
394 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  24.48 
 
 
422 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  24.48 
 
 
422 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  24.48 
 
 
422 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0561  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.1 
 
 
407 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1724  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.9 
 
 
377 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.73 
 
 
375 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  24.48 
 
 
422 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1852  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.751172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  25.77 
 
 
422 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0631  peptidase M20  26.42 
 
 
433 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.5 
 
 
377 aa  49.3  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2196  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.41 
 
 
385 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  24.48 
 
 
422 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0078  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.66 
 
 
397 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  25.58 
 
 
411 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.91 
 
 
387 aa  48.5  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.65 
 
 
378 aa  48.5  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  24.48 
 
 
422 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.01 
 
 
391 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.36 
 
 
366 aa  48.1  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>