More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0398 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1736  sigma-54 dependent DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 
512 aa  1024    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000666871  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0398  sigma-54 dependent DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 
512 aa  1024    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0197022  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1548  sigma-54 dependent DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 
512 aa  1024    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000048487  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0363  sigma-54 dependent DNA-binding transcriptional regulator  99.8 
 
 
506 aa  1010    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0237331  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5400  putative sigma54 specific transcriptional regulator  83.84 
 
 
510 aa  807    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.397817 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1241  sigma-54 dependent DNA-binding transcriptional regulator  99.59 
 
 
486 aa  967    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00296239  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0129  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  84.04 
 
 
492 aa  791    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3276  putative sigma54 specific transcriptional regulator  82.42 
 
 
498 aa  810    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427162  normal  0.0190691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6938  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  74.95 
 
 
492 aa  734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.776429  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5529  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  83.84 
 
 
495 aa  808    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2210  sigma-54 dependent DNA-binding transcriptional regulator  91.52 
 
 
495 aa  875    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000404339  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3005  sigma-54 dependent transcriptional regulator  98.24 
 
 
506 aa  945    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526118  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2979  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  75.91 
 
 
491 aa  740    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0548  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  66.8 
 
 
514 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0261172 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2889  sigma-54 dependent transcriptional regulator  99.8 
 
 
512 aa  1024    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4743  putative sigma54 specific transcriptional regulator  83.84 
 
 
495 aa  790    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5332  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  83.84 
 
 
495 aa  808    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4279  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  76.81 
 
 
486 aa  726    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4853  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  83.64 
 
 
513 aa  802    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3727  helix-turn-helix, Fis-type  64.18 
 
 
503 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2716  putative sigma54 specific transcriptional regulator  59.22 
 
 
460 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0740444  normal  0.0319328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3077  sigma54 specific transcriptional regulator  56.35 
 
 
475 aa  532  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2649  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  57.79 
 
 
460 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3284  putative transcriptional regulator  56.97 
 
 
481 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2791  putative sigma54 specific transcriptional regulator  57.26 
 
 
462 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389453  normal  0.0964858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38570  putative transcriptional regulator  58.19 
 
 
456 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1549  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3075  sigma-54 dependent transcriptional regulator  57.79 
 
 
481 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353406  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17610  sigma54-dependent activator protein  53.47 
 
 
466 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4047  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.36 
 
 
486 aa  478  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4358  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  51.05 
 
 
492 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0455  helix-turn-helix, Fis-type  50.52 
 
 
468 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2530  putative sigma54 specific transcriptional regulator  50.1 
 
 
510 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2067  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  48.53 
 
 
504 aa  425  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.408282  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2414  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  48.73 
 
 
514 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59503  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0084  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49.59 
 
 
470 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2009  sigma-54 factor, interaction region  44.29 
 
 
468 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0792  hypothetical protein  37.85 
 
 
662 aa  317  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2600  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.89 
 
 
585 aa  315  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0808  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.51 
 
 
591 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000794554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1494  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37 
 
 
470 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0444  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.23 
 
 
482 aa  298  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2866  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.88 
 
 
703 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0346  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.7 
 
 
468 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.143008  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1933  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38 
 
 
474 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2055  transcriptional regulator  37.14 
 
 
600 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000658727  hitchhiker  0.000375363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3285  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.13 
 
 
609 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2688  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.18 
 
 
597 aa  280  6e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0456  hypothetical protein  35.68 
 
 
586 aa  279  7e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0220  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.42 
 
 
599 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.205881  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2803  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.51 
 
 
569 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2816  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.2 
 
 
591 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2710  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  34.64 
 
 
579 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.077579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1438  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.28 
 
 
592 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1910  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.28 
 
 
562 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000822204  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3890  helix-turn-helix, Fis-type  36.56 
 
 
577 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2741  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.53 
 
 
471 aa  267  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0306  hypothetical protein  35.56 
 
 
582 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3598  proprionate catabolism activator, Fis family  35.76 
 
 
639 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.00055082  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3051  transcriptional regulator  32.65 
 
 
465 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06720  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.31 
 
 
581 aa  262  8.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2050  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.05 
 
 
511 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.155124  hitchhiker  0.000156568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1100  putative sigma54 specific transcriptional regulator  36.36 
 
 
586 aa  260  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0303  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.97 
 
 
576 aa  260  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.535404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2955  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.66 
 
 
559 aa  256  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2667  sigma-54 dependent transcriptional regulator/sensory box protein  37.26 
 
 
668 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2057  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.73 
 
 
448 aa  255  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2181  putative sigma54 specific transcriptional regulator  36.73 
 
 
594 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000200827 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2353  phosphocarrier HPr/sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  36.43 
 
 
668 aa  254  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0747  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.98 
 
 
464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0079  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.12 
 
 
564 aa  253  6e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0879  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.44 
 
 
489 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1807  PAS:helix-turn-helix, Fis-type:propionate catabolism activator, N-terminal  38.09 
 
 
663 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.66 
 
 
463 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1024  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.72 
 
 
544 aa  251  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000701357  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1785  NifA subfamily transcriptional regulator  41.74 
 
 
507 aa  251  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0433  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40 
 
 
472 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6322  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.16 
 
 
458 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.385665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0260  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.02 
 
 
687 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6734  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.16 
 
 
458 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321079  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6499  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.16 
 
 
458 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3217  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.49 
 
 
501 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5518  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.22 
 
 
662 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5343  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.22 
 
 
662 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2596  sigma-54-dependent transcriptional activator  36.86 
 
 
553 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.491073  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2362  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.29 
 
 
479 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2887  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.25 
 
 
553 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.635181  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1719  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.55 
 
 
582 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2865  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.25 
 
 
553 aa  248  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0882219  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.76 
 
 
575 aa  248  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0050  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.37 
 
 
515 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0532507 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2645  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.86 
 
 
553 aa  247  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643123  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2836  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.86 
 
 
553 aa  247  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0181169  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1951  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.33 
 
 
470 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516267  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2842  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.86 
 
 
553 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000148111 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2340  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.89 
 
 
476 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1698  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.05 
 
 
457 aa  246  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000740904 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2561  sigma-54-dependent transcriptional activator  36.86 
 
 
553 aa  246  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4754  Fis family proprionate catabolism activator  43.7 
 
 
662 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.574647  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1319  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.66 
 
 
452 aa  246  8e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6059  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.77 
 
 
458 aa  246  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0839917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>