More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1297 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1297  Flp pilus assembly protein ATPase  100 
 
 
355 aa  707    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0120  type II/IV secretion system protein  56.05 
 
 
358 aa  338  8e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  46.67 
 
 
386 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  43.73 
 
 
396 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  42.68 
 
 
387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  47.7 
 
 
419 aa  212  7e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  45.45 
 
 
396 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  45.12 
 
 
390 aa  205  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  44.18 
 
 
387 aa  202  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  42.07 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0619  type II secretion system protein E  44.84 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18190  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  44.17 
 
 
441 aa  196  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.654314  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  42.86 
 
 
514 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  42.05 
 
 
395 aa  195  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  42.61 
 
 
378 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  41.29 
 
 
372 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  39.53 
 
 
634 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  35.8 
 
 
442 aa  190  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  39.17 
 
 
638 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  42.44 
 
 
422 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  43.1 
 
 
433 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  40.95 
 
 
352 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  43.97 
 
 
415 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  34.75 
 
 
473 aa  185  9e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  36.42 
 
 
444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  42.95 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  39.14 
 
 
474 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  39.73 
 
 
472 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  39.73 
 
 
472 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0324  type II secretion system protein E  46.39 
 
 
383 aa  182  8.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.20864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  36.75 
 
 
463 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  44.14 
 
 
437 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  37.3 
 
 
563 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  37.83 
 
 
488 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  36.21 
 
 
472 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  38.08 
 
 
442 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  45.07 
 
 
383 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  36.61 
 
 
498 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  35.95 
 
 
479 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  36.33 
 
 
449 aa  180  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  38.26 
 
 
572 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  38.38 
 
 
438 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  35.84 
 
 
560 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  36.42 
 
 
465 aa  179  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  37.3 
 
 
639 aa  179  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  39 
 
 
450 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  41.3 
 
 
408 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  37.67 
 
 
445 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  46.45 
 
 
400 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  37.37 
 
 
594 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  38.21 
 
 
520 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  36.39 
 
 
480 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  36.75 
 
 
441 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  38.21 
 
 
521 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  38.26 
 
 
521 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  38.21 
 
 
523 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  38.21 
 
 
523 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  36.39 
 
 
416 aa  178  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  37.17 
 
 
483 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  38.21 
 
 
520 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  36.07 
 
 
492 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  38.21 
 
 
520 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  39.32 
 
 
452 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  38.26 
 
 
569 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  45.36 
 
 
379 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  33.82 
 
 
467 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  38.16 
 
 
515 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  38.74 
 
 
452 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  37.79 
 
 
389 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  33.75 
 
 
412 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  36.63 
 
 
484 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  35.43 
 
 
491 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  36.09 
 
 
472 aa  175  9e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  36.21 
 
 
490 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  36.61 
 
 
482 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  35.89 
 
 
521 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  41.37 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  39.03 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  36.18 
 
 
482 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  36.18 
 
 
491 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  45.36 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  36.51 
 
 
482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  37.42 
 
 
488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  37.07 
 
 
440 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  35.55 
 
 
467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  36.49 
 
 
449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  36.18 
 
 
482 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  35.64 
 
 
624 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  36.63 
 
 
433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  38.67 
 
 
449 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  44.33 
 
 
401 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  42.01 
 
 
388 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  36.18 
 
 
485 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  38.54 
 
 
589 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  35.27 
 
 
608 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  35.86 
 
 
485 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  37.09 
 
 
471 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  37.09 
 
 
489 aa  172  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  37.33 
 
 
445 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  36.09 
 
 
468 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>