More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0120 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0120  type II/IV secretion system protein  100 
 
 		 358 aa  727    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1297  Flp pilus assembly protein ATPase  56.05 
 
 		 355 aa  349  5e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  43.84 
 
 		 386 aa  257  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  47.12 
 
 		 419 aa  231  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  46.15 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  39.53 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  41.16 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18190  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  41.46 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.654314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  44.55 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  41.61 
 
 		 395 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  41 
 
 		 352 aa  205  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  40.76 
 
 		 372 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0619  type II secretion system protein E  42.27 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  42.44 
 
 		 390 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  38.92 
 
 		 378 aa  199  7e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  38.24 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  40.96 
 
 		 514 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  37.61 
 
 		 393 aa  195  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  43.95 
 
 		 401 aa  195  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  39.74 
 
 		 388 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  41.18 
 
 		 389 aa  193  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  45.26 
 
 		 401 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  39.09 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  41.3 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  35.21 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  39.09 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  39.74 
 
 		 422 aa  185  9e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  38.01 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  42.81 
 
 		 405 aa  182  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  42.27 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  41.61 
 
 		 415 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  41.9 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  42.11 
 
 		 383 aa  179  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  37.58 
 
 		 467 aa  178  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  42.71 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  36.79 
 
 		 639 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  36.68 
 
 		 468 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  34.59 
 
 		 473 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  40.41 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  33.43 
 
 		 449 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  35.59 
 
 		 428 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  35.59 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  35.59 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  34.11 
 
 		 563 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  37.29 
 
 		 624 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  36.33 
 
 		 472 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0324  type II secretion system protein E  46.05 
 
 		 383 aa  172  9e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.20864  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  36.15 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  36.24 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  40.14 
 
 		 398 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  33.73 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  35.64 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  34.56 
 
 		 453 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  35.07 
 
 		 634 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  35.99 
 
 		 441 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  35.15 
 
 		 463 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  34.06 
 
 		 560 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  36.13 
 
 		 515 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  35.53 
 
 		 523 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  35.53 
 
 		 520 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  35.53 
 
 		 520 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  35.53 
 
 		 520 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  35.53 
 
 		 521 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  35.53 
 
 		 523 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  34.03 
 
 		 445 aa  169  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  36.24 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  33.13 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  35.86 
 
 		 452 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  37.28 
 
 		 416 aa  168  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  35.71 
 
 		 463 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  32.72 
 
 		 444 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  37.38 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  35.35 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  35.19 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  35.45 
 
 		 474 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  36.97 
 
 		 608 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  34.93 
 
 		 488 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  34.59 
 
 		 482 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  34.59 
 
 		 442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  34.6 
 
 		 454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  34.01 
 
 		 432 aa  166  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  34.85 
 
 		 594 aa  166  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  34.25 
 
 		 490 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  36.54 
 
 		 464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  36.27 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  33.91 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  34.65 
 
 		 474 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  34.93 
 
 		 485 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  36.82 
 
 		 638 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  35.64 
 
 		 456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  33.14 
 
 		 452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  35.64 
 
 		 459 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  34.47 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  33.56 
 
 		 467 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  33.9 
 
 		 489 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  34.26 
 
 		 455 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  34.93 
 
 		 480 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  34.26 
 
 		 455 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  34.26 
 
 		 455 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>