More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1512 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1512  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 478 aa  963    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222559 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  37.39 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  38.02 
 
 		 263 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  35.06 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  37.19 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  39.64 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  37.72 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  35.67 
 
 		 262 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  40.54 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  40.54 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  40.71 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  36.13 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  38.74 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  36.8 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  36.8 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  36.67 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  37.07 
 
 		 345 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  37.72 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.26 
 
 		 407 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  37.21 
 
 		 270 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  37.6 
 
 		 218 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 205 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.28 
 
 		 673 aa  65.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  29.66 
 
 		 656 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  34.45 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  37.21 
 
 		 270 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  34.4 
 
 		 200 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  36.75 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.05 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  33.57 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  33.74 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  36.75 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.72 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  37.21 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  36.75 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  37.6 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.61 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  37.6 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  32.1 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  38.05 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  32.46 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  37.61 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 		 326 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 		 229 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  38.05 
 
 		 350 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  34.38 
 
 		 271 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  35.16 
 
 		 270 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 219 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  38.05 
 
 		 350 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  35.71 
 
 		 219 aa  63.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  38.05 
 
 		 351 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  35.14 
 
 		 320 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 232 aa  62.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  31.14 
 
 		 217 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  34.51 
 
 		 223 aa  62.4  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  34.23 
 
 		 215 aa  62.4  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  34.88 
 
 		 270 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 		 193 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  39.23 
 
 		 228 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  36.36 
 
 		 229 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  40.37 
 
 		 261 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  36.36 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  34.82 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  35.65 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  30.36 
 
 		 1793 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  32.26 
 
 		 637 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  34.48 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  31.82 
 
 		 175 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  34.48 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  33.93 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  37.69 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  33.93 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.44 
 
 		 607 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  33.93 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  35.78 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  32.14 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  32.06 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0615  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  36.7 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  35.78 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  34.51 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  38.94 
 
 		 327 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  33.63 
 
 		 212 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  35.78 
 
 		 269 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  35.78 
 
 		 269 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  34.51 
 
 		 217 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  38.89 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  36.61 
 
 		 209 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2170  OmpA/MotB domain-containing protein  32.31 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161948  normal  0.187481 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0146  OmpA/MotB  35.65 
 
 		 187 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  38.89 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  32.43 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  31.58 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  33.59 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  34.51 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>