156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5087 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  100 
 
 		 265 aa  534  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  73.95 
 
 		 273 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  75.1 
 
 		 295 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  73.56 
 
 		 271 aa  402  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  71.65 
 
 		 273 aa  391  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  72.2 
 
 		 276 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  65.52 
 
 		 285 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  66.41 
 
 		 285 aa  367  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  67.05 
 
 		 283 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  66.67 
 
 		 283 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  65.13 
 
 		 285 aa  364  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  66.28 
 
 		 289 aa  362  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  68.97 
 
 		 286 aa  347  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  62.45 
 
 		 273 aa  343  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  60.54 
 
 		 271 aa  340  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  61.45 
 
 		 285 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  50.19 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  38.72 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  33.47 
 
 		 332 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  34.15 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  35.63 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  35.41 
 
 		 599 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  35.14 
 
 		 305 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  32.66 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  34.05 
 
 		 276 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  29.37 
 
 		 322 aa  95.9  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  30.13 
 
 		 329 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  28.16 
 
 		 299 aa  89.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  31.21 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  32.33 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  33.08 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  27.86 
 
 		 326 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  34.02 
 
 		 298 aa  86.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  32.9 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  31.95 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  29.73 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  34.48 
 
 		 590 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  29.84 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  36.99 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  29.06 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  29.23 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  31.36 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  33.49 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  33.19 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  30.21 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  25.82 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  30.59 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  29.68 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  30.25 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  33.19 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  29.86 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  31.21 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  30.5 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  28.91 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  29.72 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  32.49 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  29.55 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  35.59 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  28.91 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  35.15 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  30.74 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  33.75 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  33.75 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  25.3 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  33.75 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  34.19 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  31.76 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  35.94 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.95 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  31.61 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3550  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.87 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2873  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.44 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.51 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3951  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  29.88 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3593  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.88 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.310124  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1036  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  29.96 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.138374  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1871  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.46 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.9 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5289  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.18 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1229  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  31.25 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000422585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.02 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2597  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.36 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  27.47 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  26.05 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.08 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5059  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  32.42 
 
 		 226 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00434544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1076  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  29.33 
 
 		 221 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.51 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.19 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3946  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.19 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.358275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.09 
 
 		 228 aa  49.3  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.26 
 
 		 237 aa  48.9  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5585  coenzyme A transferase  29 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6799  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.68 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.66 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4435  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.89 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.98 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2003  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  27.63 
 
 		 220 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.881736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.77 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138899  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.11 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>