More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3946 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3946  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 
233 aa  470  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.358275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5561  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  84.98 
 
 
233 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.670135  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0865  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  84.55 
 
 
236 aa  408  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2873  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  81.82 
 
 
231 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3550  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  82.25 
 
 
231 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520535  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4435  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  82.4 
 
 
233 aa  398  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1036  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  78.54 
 
 
233 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.138374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1229  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  78.15 
 
 
238 aa  363  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000422585  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.44 
 
 
233 aa  348  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  73.82 
 
 
233 aa  345  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.2 
 
 
235 aa  341  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  72.2 
 
 
237 aa  341  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0643  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A (pcaI)  72.15 
 
 
233 aa  340  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.371061  normal  0.0641252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1871  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70.78 
 
 
231 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3951  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  70.32 
 
 
231 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  71.95 
 
 
237 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1552  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  71.95 
 
 
237 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0067  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  71.95 
 
 
282 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200296  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3593  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70.32 
 
 
231 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.310124  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0056  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  71.95 
 
 
282 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1200  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  71.95 
 
 
282 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0054  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  71.95 
 
 
282 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1483  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  71.95 
 
 
282 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2597  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68 
 
 
230 aa  333  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5288  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70.59 
 
 
237 aa  331  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595074  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3129  3-oxoadipate CoA-transferase  70.59 
 
 
237 aa  330  9e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2254  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A protein  73.06 
 
 
229 aa  330  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0955089  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5585  coenzyme A transferase  71.69 
 
 
246 aa  330  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5289  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70.32 
 
 
231 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2459  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.69 
 
 
231 aa  329  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.695651  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2066  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.69 
 
 
231 aa  329  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0689657  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70.14 
 
 
238 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5113  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  70.14 
 
 
238 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70.14 
 
 
238 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503398 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3158  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.23 
 
 
238 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913746  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5017  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.23 
 
 
238 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1262  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  69.09 
 
 
230 aa  322  4e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.23 
 
 
219 aa  320  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138899  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3667  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  70.33 
 
 
221 aa  310  9e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.12 
 
 
225 aa  306  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0526  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.49 
 
 
232 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0564  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.36 
 
 
232 aa  301  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.802929  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.58 
 
 
233 aa  300  9e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4594  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.04 
 
 
228 aa  300  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1730  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.04 
 
 
232 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1680  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.04 
 
 
232 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514841  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.04 
 
 
232 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1702  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  65.04 
 
 
232 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.125286  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65 
 
 
220 aa  297  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5059  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  65.44 
 
 
226 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00434544  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.06 
 
 
228 aa  295  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4072  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.3 
 
 
219 aa  294  9e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.82 
 
 
227 aa  292  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.359655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1506  coenzyme A transferase  66.37 
 
 
232 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1120  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.22 
 
 
225 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4403  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.36 
 
 
232 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189982  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1113  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.93 
 
 
231 aa  281  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1076  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  61.47 
 
 
221 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190915  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3086  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.82 
 
 
221 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1504  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.75 
 
 
223 aa  262  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  55.2 
 
 
276 aa  259  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3720  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.34 
 
 
235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5885  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.73 
 
 
235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5020  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.41 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6799  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.82 
 
 
235 aa  252  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704148  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0600  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  58.26 
 
 
235 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0638  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  57.8 
 
 
235 aa  251  5.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3710  3-oxoacid CoA-transferase  55.11 
 
 
236 aa  249  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1846  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.16 
 
 
228 aa  247  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6120  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  53.71 
 
 
235 aa  246  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.5 
 
 
235 aa  246  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  52.34 
 
 
302 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4027  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.23 
 
 
223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.071671  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  51.11 
 
 
229 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.14 
 
 
233 aa  216  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  51.91 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  51.49 
 
 
234 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  51.49 
 
 
234 aa  214  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  51.49 
 
 
234 aa  214  7e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.52 
 
 
463 aa  214  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  51.49 
 
 
234 aa  214  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  51.49 
 
 
234 aa  214  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  51.49 
 
 
234 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.09 
 
 
245 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48 
 
 
229 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  48.85 
 
 
253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1563  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.53 
 
 
234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.64 
 
 
234 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.64 
 
 
237 aa  211  9e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4610  3-oxoacid CoA-transferase  50.64 
 
 
234 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000693974  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1390  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.21 
 
 
234 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2761  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.07 
 
 
234 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527249  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.58 
 
 
235 aa  208  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  48.05 
 
 
237 aa  208  6e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  48.05 
 
 
237 aa  208  6e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.95 
 
 
245 aa  208  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
236 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3467  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.7 
 
 
235 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1140  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.77 
 
 
232 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.373341 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.85 
 
 
233 aa  206  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>