More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0518 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  100 
 
 
253 aa  518  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3291  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  91.45 
 
 
235 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0656  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  91.45 
 
 
235 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3467  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  91.03 
 
 
235 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1598  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, alpha subunit  79.91 
 
 
239 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.844563  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01941  putative succinyl-CoA transferase, alpha subunit  73.93 
 
 
235 aa  358  3e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546528  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0590  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  73.59 
 
 
232 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70.64 
 
 
239 aa  353  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3055  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  74.68 
 
 
234 aa  350  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.184306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2076  3-oxoacid CoA-transferase  75.32 
 
 
232 aa  348  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3122  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  75.32 
 
 
232 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.408127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2735  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  75.32 
 
 
232 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2594  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  75.32 
 
 
232 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1140  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  73.59 
 
 
232 aa  346  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.373341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3295  putative CoA transferase, subunit A  73.16 
 
 
232 aa  345  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38660  putative CoA transferase, subunit A  73.16 
 
 
232 aa  345  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2431  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  74.46 
 
 
232 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.53 
 
 
234 aa  343  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.53 
 
 
234 aa  343  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.7 
 
 
233 aa  343  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1714  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.1 
 
 
234 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.8 
 
 
244 aa  342  4e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1892  acetate CoA-transferase, subunit A  69.1 
 
 
234 aa  342  5e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51610  3-oxoacid CoA-transferase  72.29 
 
 
232 aa  339  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2851  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.67 
 
 
234 aa  338  5e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.67 
 
 
234 aa  338  5e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1525  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.67 
 
 
234 aa  338  5e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2978  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.67 
 
 
234 aa  338  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1667  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.67 
 
 
234 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3228  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.95 
 
 
234 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.761635  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1670  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  69.13 
 
 
235 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.835044  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2732  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.81 
 
 
234 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3455  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A family  71.24 
 
 
233 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3237  3-oxoacid CoA-transferase  70.82 
 
 
233 aa  334  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.870367  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1453  3-oxoacid CoA-transferase  66.95 
 
 
237 aa  333  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00126643  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1357  3-oxoacid CoA-transferase  71 
 
 
233 aa  331  5e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2251  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  66.67 
 
 
237 aa  322  5e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.5 
 
 
234 aa  309  2.9999999999999997e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2340  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  65.65 
 
 
234 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6963  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.57 
 
 
231 aa  303  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.550727  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64 
 
 
463 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  62.11 
 
 
229 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4701  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.23 
 
 
242 aa  300  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196334  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  62.61 
 
 
302 aa  298  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1914  3-ketoacid CoA transferase alpha subunit  64.63 
 
 
232 aa  298  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0564  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.63 
 
 
232 aa  298  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0888  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.45 
 
 
233 aa  297  9e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  62.5 
 
 
233 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  61.74 
 
 
232 aa  295  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.77 
 
 
231 aa  295  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.26 
 
 
236 aa  294  9e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  61.74 
 
 
234 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.38 
 
 
233 aa  294  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  61.74 
 
 
234 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  61.74 
 
 
234 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  61.74 
 
 
234 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  61.74 
 
 
234 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  61.74 
 
 
234 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  61.74 
 
 
234 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.74 
 
 
234 aa  292  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.43 
 
 
233 aa  293  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1505  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.04 
 
 
237 aa  291  5e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571069  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.63 
 
 
233 aa  291  7e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.7 
 
 
237 aa  291  9e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1563  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.87 
 
 
234 aa  290  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2918  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.33 
 
 
233 aa  289  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000077275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4610  3-oxoacid CoA-transferase  60.87 
 
 
234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000693974  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4683  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.64 
 
 
245 aa  288  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.728384 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  61.57 
 
 
237 aa  287  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  61.74 
 
 
244 aa  287  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1390  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60 
 
 
234 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1163  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  57.26 
 
 
235 aa  286  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1009  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  61.9 
 
 
231 aa  285  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.996272  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  62.33 
 
 
244 aa  285  5e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  61.14 
 
 
237 aa  284  9e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.09 
 
 
233 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.13 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.15 
 
 
229 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.37 
 
 
245 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.7 
 
 
245 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.7 
 
 
245 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3108  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.63 
 
 
232 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0784994  normal  0.0838265 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.23 
 
 
235 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17570  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  62.5 
 
 
232 aa  278  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0517  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.96 
 
 
243 aa  278  6e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2761  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.26 
 
 
234 aa  278  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527249  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.39 
 
 
245 aa  278  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1706  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.04 
 
 
233 aa  277  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.39 
 
 
235 aa  277  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1153  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  62.17 
 
 
232 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03105  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  60.7 
 
 
233 aa  277  1e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.433161  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  58.7 
 
 
238 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.51 
 
 
235 aa  276  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  59.13 
 
 
238 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6830  acetyl-CoA/acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  57.83 
 
 
242 aa  275  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.261495  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3823  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.52 
 
 
242 aa  275  7e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4164  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.46 
 
 
235 aa  275  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1443  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.43 
 
 
234 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158358  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2123  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  60 
 
 
236 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.678104  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5436  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  59.39 
 
 
235 aa  274  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>