More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1706 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1706  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 
233 aa  470  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  85.34 
 
 
237 aa  411  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  84.91 
 
 
237 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  77.59 
 
 
302 aa  374  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  76.86 
 
 
234 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  76.86 
 
 
234 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  76.86 
 
 
234 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  76.42 
 
 
234 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  76.86 
 
 
234 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  76.86 
 
 
234 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  76.86 
 
 
234 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  78.6 
 
 
234 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1563  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  77.73 
 
 
234 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  76.86 
 
 
233 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4610  3-oxoacid CoA-transferase  77.29 
 
 
234 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000693974  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1390  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  77.29 
 
 
234 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2761  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  75.11 
 
 
234 aa  360  9e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527249  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  74.24 
 
 
232 aa  359  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  75.88 
 
 
267 aa  355  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  72.41 
 
 
244 aa  354  6.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  73.91 
 
 
233 aa  353  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  72.17 
 
 
244 aa  351  5e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1153  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  76.86 
 
 
232 aa  349  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0983  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  76.86 
 
 
234 aa  347  9e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1465  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  76.86 
 
 
234 aa  347  9e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1443  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  76.86 
 
 
234 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158358  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1350  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  76.42 
 
 
234 aa  345  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.69 
 
 
272 aa  341  5.999999999999999e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.05 
 
 
233 aa  340  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.49 
 
 
233 aa  339  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  75.11 
 
 
233 aa  339  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1983  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  75.11 
 
 
233 aa  338  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0517  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.74 
 
 
243 aa  338  5e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1366  3-oxoacid CoA-transferase  75.55 
 
 
234 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1456  3-oxoacid CoA-transferase  74.12 
 
 
235 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0699745  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17570  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  75.11 
 
 
232 aa  336  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.74 
 
 
235 aa  332  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70.93 
 
 
270 aa  330  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.24 
 
 
236 aa  324  7e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4266  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.25 
 
 
235 aa  322  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.367586  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1961  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.05 
 
 
235 aa  319  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1762  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.05 
 
 
235 aa  319  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.94 
 
 
237 aa  318  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.69 
 
 
234 aa  318  3.9999999999999996e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2635  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  70.61 
 
 
239 aa  314  8e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  67.54 
 
 
229 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1905  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  70.18 
 
 
235 aa  312  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0564  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.07 
 
 
232 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.07 
 
 
463 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1914  3-ketoacid CoA transferase alpha subunit  65.07 
 
 
232 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507414  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3228  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.43 
 
 
234 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.761635  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2340  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  64.04 
 
 
234 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0959  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.76 
 
 
235 aa  305  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248714  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.12 
 
 
233 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.32 
 
 
235 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5436  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  65.64 
 
 
235 aa  302  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.45 
 
 
245 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.45 
 
 
245 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.94 
 
 
255 aa  300  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.01 
 
 
235 aa  299  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1453  3-oxoacid CoA-transferase  66.38 
 
 
237 aa  298  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00126643  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2918  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.45 
 
 
233 aa  298  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000077275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.09 
 
 
245 aa  298  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.25 
 
 
244 aa  298  6e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.04 
 
 
231 aa  298  6e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6963  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.32 
 
 
231 aa  298  7e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.550727  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4164  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.01 
 
 
235 aa  296  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.14 
 
 
245 aa  296  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4635  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.61 
 
 
238 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.853485  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  63.48 
 
 
238 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2123  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  64.19 
 
 
236 aa  296  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.678104  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  62.61 
 
 
238 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4683  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.76 
 
 
245 aa  295  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.728384 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.14 
 
 
233 aa  294  6e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.81 
 
 
234 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2851  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.81 
 
 
234 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2978  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.81 
 
 
234 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1714  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.81 
 
 
234 aa  293  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1525  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.81 
 
 
234 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  65.04 
 
 
253 aa  293  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3847  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.61 
 
 
236 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584651  normal  0.485272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6830  acetyl-CoA/acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  62.17 
 
 
242 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.261495  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3108  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.5 
 
 
232 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0784994  normal  0.0838265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.72 
 
 
229 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1892  acetate CoA-transferase, subunit A  66.81 
 
 
234 aa  292  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.81 
 
 
234 aa  292  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.81 
 
 
234 aa  292  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.82 
 
 
255 aa  291  5e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0351  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.9 
 
 
236 aa  291  6e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.901849  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0888  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.05 
 
 
233 aa  290  9e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3823  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.43 
 
 
242 aa  290  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1598  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, alpha subunit  68.42 
 
 
239 aa  288  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.844563  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.5 
 
 
274 aa  289  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.16 
 
 
250 aa  288  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2732  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.07 
 
 
234 aa  288  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1667  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.38 
 
 
234 aa  288  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1246  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  62.5 
 
 
235 aa  287  8e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0572  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  64.47 
 
 
235 aa  287  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0035741  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0568  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  62.34 
 
 
236 aa  286  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.95839  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1010  coenzyme A transferase  60.99 
 
 
329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436488  normal  0.300515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>