More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3455 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3455  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A family  100 
 
 
233 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3237  3-oxoacid CoA-transferase  98.28 
 
 
233 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.870367  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0590  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  83.55 
 
 
232 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2735  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  86.15 
 
 
232 aa  400  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3122  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  86.15 
 
 
232 aa  400  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.408127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2594  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  86.15 
 
 
232 aa  400  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2431  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  85.71 
 
 
232 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51610  3-oxoacid CoA-transferase  87.01 
 
 
232 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3295  putative CoA transferase, subunit A  84.85 
 
 
232 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38660  putative CoA transferase, subunit A  84.85 
 
 
232 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01941  putative succinyl-CoA transferase, alpha subunit  79.31 
 
 
235 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1670  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  78.54 
 
 
235 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.835044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1140  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  83.19 
 
 
232 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.373341 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  75.97 
 
 
239 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3055  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  81.97 
 
 
234 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.184306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2076  3-oxoacid CoA-transferase  79.31 
 
 
232 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1598  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, alpha subunit  77.68 
 
 
239 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.844563  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  73.71 
 
 
233 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.53 
 
 
234 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.53 
 
 
234 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1714  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.1 
 
 
234 aa  359  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1892  acetate CoA-transferase, subunit A  72.1 
 
 
234 aa  358  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1667  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.53 
 
 
234 aa  358  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2851  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.24 
 
 
234 aa  354  5e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2978  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.24 
 
 
234 aa  354  5e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1525  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.24 
 
 
234 aa  354  5e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.24 
 
 
234 aa  354  5e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3228  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.1 
 
 
234 aa  353  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.761635  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.43 
 
 
244 aa  351  5e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  71.24 
 
 
253 aa  350  7e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2732  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.53 
 
 
234 aa  350  8e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1453  3-oxoacid CoA-transferase  69.53 
 
 
237 aa  348  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00126643  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0656  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  74.25 
 
 
235 aa  345  4e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3467  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  74.25 
 
 
235 aa  344  8e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3291  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  74.25 
 
 
235 aa  343  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1357  3-oxoacid CoA-transferase  72.53 
 
 
233 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2251  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  69.96 
 
 
237 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.74 
 
 
234 aa  305  4.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  62.95 
 
 
229 aa  304  8.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  66.09 
 
 
302 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  65.5 
 
 
244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  64.78 
 
 
234 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  64.78 
 
 
234 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  64.78 
 
 
234 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  64.78 
 
 
234 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  64.78 
 
 
234 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  64.78 
 
 
234 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  64.78 
 
 
234 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.65 
 
 
234 aa  301  9e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1390  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.78 
 
 
234 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.58 
 
 
236 aa  299  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4610  3-oxoacid CoA-transferase  64.78 
 
 
234 aa  298  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000693974  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1563  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.78 
 
 
234 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4701  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.65 
 
 
242 aa  296  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196334  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.02 
 
 
237 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  63.48 
 
 
232 aa  295  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0888  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.45 
 
 
233 aa  295  5e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.61 
 
 
233 aa  294  6e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  67.13 
 
 
244 aa  293  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.28 
 
 
463 aa  292  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.36 
 
 
233 aa  291  8e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1163  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  60.61 
 
 
235 aa  290  9e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  62.5 
 
 
233 aa  290  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1914  3-ketoacid CoA transferase alpha subunit  63.27 
 
 
232 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0564  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.27 
 
 
232 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.42 
 
 
233 aa  290  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0517  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.16 
 
 
243 aa  286  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2918  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.52 
 
 
233 aa  286  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000077275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2761  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.65 
 
 
234 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527249  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4683  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.66 
 
 
245 aa  284  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.728384 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1443  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.22 
 
 
234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158358  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0983  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  65.22 
 
 
234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1465  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.22 
 
 
234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  63.39 
 
 
237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1350  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.22 
 
 
234 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  63.84 
 
 
237 aa  282  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.44 
 
 
231 aa  281  5.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6963  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.21 
 
 
231 aa  281  6.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.550727  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.73 
 
 
255 aa  277  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.73 
 
 
245 aa  277  9e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.73 
 
 
245 aa  277  9e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6830  acetyl-CoA/acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  58.87 
 
 
242 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.261495  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3847  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.5 
 
 
236 aa  277  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584651  normal  0.485272 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  58.87 
 
 
238 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.73 
 
 
245 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17570  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  64.22 
 
 
232 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.34 
 
 
233 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.05 
 
 
272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  57.58 
 
 
238 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3823  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.82 
 
 
242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03105  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  60.43 
 
 
233 aa  272  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.433161  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2340  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  58.95 
 
 
234 aa  272  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.82 
 
 
245 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.65 
 
 
270 aa  271  6e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.7 
 
 
235 aa  271  7e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.22 
 
 
255 aa  271  9e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4635  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.14 
 
 
238 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.853485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.44 
 
 
229 aa  270  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3108  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.39 
 
 
232 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0784994  normal  0.0838265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5001  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.81 
 
 
246 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0462314  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>