More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0590 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0590  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1670  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  86.09 
 
 
235 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.835044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3295  putative CoA transferase, subunit A  87.88 
 
 
232 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38660  putative CoA transferase, subunit A  87.88 
 
 
232 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1140  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  85.34 
 
 
232 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.373341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3455  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A family  83.55 
 
 
233 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3237  3-oxoacid CoA-transferase  83.98 
 
 
233 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.870367  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51610  3-oxoacid CoA-transferase  83.98 
 
 
232 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2735  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  81.82 
 
 
232 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3122  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  81.82 
 
 
232 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.408127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2594  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  81.82 
 
 
232 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2431  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  81.82 
 
 
232 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  75.22 
 
 
239 aa  380  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2076  3-oxoacid CoA-transferase  81.82 
 
 
232 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01941  putative succinyl-CoA transferase, alpha subunit  76.52 
 
 
235 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546528  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3055  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  79.31 
 
 
234 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.184306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1598  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, alpha subunit  77.92 
 
 
239 aa  361  6e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.844563  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.29 
 
 
234 aa  360  9e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.29 
 
 
234 aa  360  9e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1892  acetate CoA-transferase, subunit A  71.86 
 
 
234 aa  359  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.84 
 
 
233 aa  359  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1714  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.43 
 
 
234 aa  358  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1667  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.43 
 
 
234 aa  359  3e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  73.59 
 
 
253 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1525  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71 
 
 
234 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71 
 
 
234 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2851  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71 
 
 
234 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2978  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71 
 
 
234 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2732  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71 
 
 
234 aa  354  6.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.86 
 
 
244 aa  353  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3228  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.43 
 
 
234 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.761635  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1453  3-oxoacid CoA-transferase  70.13 
 
 
237 aa  350  8.999999999999999e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00126643  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0656  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  74.89 
 
 
235 aa  347  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1357  3-oxoacid CoA-transferase  73.59 
 
 
233 aa  346  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3291  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  74.89 
 
 
235 aa  345  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3467  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  74.89 
 
 
235 aa  345  3e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2251  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  71 
 
 
237 aa  339  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4701  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.57 
 
 
242 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196334  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  63.84 
 
 
229 aa  308  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.07 
 
 
234 aa  309  2.9999999999999997e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.91 
 
 
236 aa  302  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.16 
 
 
463 aa  300  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0888  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.04 
 
 
233 aa  300  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  64.78 
 
 
302 aa  300  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  63.48 
 
 
234 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  63.48 
 
 
234 aa  298  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  63.48 
 
 
234 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  63.48 
 
 
234 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  63.48 
 
 
234 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  63.48 
 
 
234 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  63.48 
 
 
234 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.19 
 
 
233 aa  296  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.96 
 
 
237 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  62.61 
 
 
232 aa  295  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1563  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.04 
 
 
234 aa  295  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.35 
 
 
233 aa  294  9e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.04 
 
 
234 aa  293  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1163  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  60.7 
 
 
235 aa  292  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  61.74 
 
 
233 aa  291  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  61.3 
 
 
238 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6830  acetyl-CoA/acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  60.87 
 
 
242 aa  289  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.261495  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4683  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.23 
 
 
245 aa  288  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.728384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  61.3 
 
 
238 aa  288  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  61.84 
 
 
244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.73 
 
 
245 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1390  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.3 
 
 
234 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1914  3-ketoacid CoA transferase alpha subunit  62.01 
 
 
232 aa  287  9e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507414  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.01 
 
 
233 aa  287  9e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0564  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.01 
 
 
232 aa  287  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4610  3-oxoacid CoA-transferase  61.3 
 
 
234 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000693974  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6963  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.83 
 
 
231 aa  286  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.550727  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.27 
 
 
255 aa  286  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.57 
 
 
245 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.83 
 
 
231 aa  285  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.57 
 
 
245 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  61.74 
 
 
244 aa  285  2.9999999999999996e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2761  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.43 
 
 
234 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527249  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4635  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60 
 
 
238 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.853485  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2918  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.39 
 
 
233 aa  284  8e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000077275 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.87 
 
 
235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1246  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  59.57 
 
 
235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.91 
 
 
245 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3823  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.4 
 
 
242 aa  281  6.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0517  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.28 
 
 
243 aa  280  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.26 
 
 
235 aa  280  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3847  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.61 
 
 
236 aa  278  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584651  normal  0.485272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3950  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  59.57 
 
 
245 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2123  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  61.06 
 
 
236 aa  276  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.678104  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.78 
 
 
229 aa  275  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1010  coenzyme A transferase  57.83 
 
 
329 aa  275  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436488  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5001  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.5 
 
 
246 aa  275  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0462314  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2340  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  58.52 
 
 
234 aa  274  7e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1350  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.17 
 
 
234 aa  274  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  61.16 
 
 
237 aa  274  8e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.7 
 
 
233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17570  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  62.77 
 
 
232 aa  273  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.39 
 
 
272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0983  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  61.74 
 
 
234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1443  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.74 
 
 
234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158358  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1465  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.74 
 
 
234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>