More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0833 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 
233 aa  470  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3946  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  73.82 
 
 
233 aa  358  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.358275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5561  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.67 
 
 
233 aa  355  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.670135  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  77.03 
 
 
235 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0865  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  73.39 
 
 
236 aa  352  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0643  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A (pcaI)  77.17 
 
 
233 aa  352  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.371061  normal  0.0641252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  76.58 
 
 
233 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4435  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  73.82 
 
 
233 aa  351  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1036  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  70.82 
 
 
233 aa  350  8e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.138374  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3550  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.17 
 
 
231 aa  349  3e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520535  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  74.77 
 
 
237 aa  348  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2873  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.74 
 
 
231 aa  348  4e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5288  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  74.66 
 
 
237 aa  348  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595074  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3129  3-oxoadipate CoA-transferase  74.66 
 
 
237 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  74.66 
 
 
238 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5113  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  74.66 
 
 
238 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  74.66 
 
 
238 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503398 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0067  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  74.66 
 
 
282 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0054  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  74.66 
 
 
282 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1483  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  74.66 
 
 
282 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0056  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  74.66 
 
 
282 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1200  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  74.66 
 
 
282 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  74.66 
 
 
237 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1552  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  74.66 
 
 
237 aa  345  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3158  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  74.66 
 
 
238 aa  345  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913746  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5017  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  74.66 
 
 
238 aa  345  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5585  coenzyme A transferase  75.8 
 
 
246 aa  343  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2459  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  74.89 
 
 
231 aa  337  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.695651  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2066  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  74.89 
 
 
231 aa  337  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0689657  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1229  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  71.01 
 
 
238 aa  336  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000422585  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1871  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.69 
 
 
231 aa  333  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3951  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  71.23 
 
 
231 aa  333  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3593  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.23 
 
 
231 aa  333  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.310124  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3667  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  76.19 
 
 
221 aa  332  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2597  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.89 
 
 
230 aa  331  6e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  73.06 
 
 
225 aa  328  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2254  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A protein  71.56 
 
 
229 aa  327  7e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0955089  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5289  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.86 
 
 
231 aa  324  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.17 
 
 
233 aa  320  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70 
 
 
220 aa  318  5e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4594  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.64 
 
 
228 aa  317  9e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1262  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  69.55 
 
 
230 aa  317  1e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.86 
 
 
219 aa  317  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138899  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4072  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.63 
 
 
219 aa  312  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1120  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.86 
 
 
225 aa  303  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.9 
 
 
228 aa  300  9e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0564  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.3 
 
 
232 aa  295  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.802929  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3086  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.47 
 
 
221 aa  292  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0526  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.3 
 
 
232 aa  291  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5059  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  63.59 
 
 
226 aa  291  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00434544  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1113  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.95 
 
 
231 aa  290  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1506  coenzyme A transferase  68.2 
 
 
232 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1730  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.82 
 
 
232 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1680  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.82 
 
 
232 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514841  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.82 
 
 
232 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1702  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  66.82 
 
 
232 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.125286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.82 
 
 
227 aa  286  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.359655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1076  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  63.3 
 
 
221 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190915  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4403  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.84 
 
 
232 aa  276  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189982  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  57.92 
 
 
276 aa  272  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3710  3-oxoacid CoA-transferase  59.73 
 
 
236 aa  266  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1504  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.13 
 
 
223 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0600  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  57.8 
 
 
235 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0638  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  57.34 
 
 
235 aa  249  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3720  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.8 
 
 
235 aa  247  9e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1846  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.53 
 
 
228 aa  245  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5885  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.36 
 
 
235 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5020  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.5 
 
 
249 aa  244  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6799  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.96 
 
 
235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704148  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6120  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  54.55 
 
 
235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.96 
 
 
235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.21 
 
 
237 aa  228  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.82 
 
 
245 aa  228  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.75 
 
 
244 aa  227  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.3 
 
 
233 aa  226  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.14 
 
 
245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  50.64 
 
 
302 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.6 
 
 
245 aa  224  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.6 
 
 
245 aa  224  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1505  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55 
 
 
237 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571069  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.05 
 
 
255 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.09 
 
 
237 aa  223  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.71 
 
 
463 aa  221  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.61 
 
 
235 aa  222  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  50.21 
 
 
234 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.56 
 
 
236 aa  221  8e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.54 
 
 
235 aa  221  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  49.79 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  49.79 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  49.79 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  49.79 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  51.14 
 
 
238 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  49.79 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  49.79 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.23 
 
 
229 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  49.78 
 
 
237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.46 
 
 
235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  51.14 
 
 
238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.79 
 
 
234 aa  218  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4635  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.45 
 
 
238 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.853485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>