More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4338 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 
225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  77.78 
 
 
233 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3158  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  77.17 
 
 
238 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913746  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5017  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  77.17 
 
 
238 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0067  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  76.71 
 
 
282 aa  348  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0054  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  76.26 
 
 
282 aa  348  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  76.26 
 
 
237 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0056  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  76.26 
 
 
282 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1552  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  76.26 
 
 
237 aa  348  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1200  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  76.26 
 
 
282 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1483  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  76.26 
 
 
282 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  74.67 
 
 
237 aa  347  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  75.56 
 
 
235 aa  347  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5288  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  75.34 
 
 
237 aa  345  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595074  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  75.34 
 
 
238 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5113  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  75.34 
 
 
238 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  75.34 
 
 
238 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3129  3-oxoadipate CoA-transferase  75.34 
 
 
237 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0643  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A (pcaI)  74.89 
 
 
233 aa  342  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.371061  normal  0.0641252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2597  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  73.66 
 
 
230 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1871  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  74.11 
 
 
231 aa  337  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5289  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  75.45 
 
 
231 aa  337  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3593  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  73.66 
 
 
231 aa  337  9e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.310124  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3951  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  73.66 
 
 
231 aa  337  9e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2066  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  74.89 
 
 
231 aa  332  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0689657  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2459  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  74.89 
 
 
231 aa  332  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.695651  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1262  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  72.4 
 
 
230 aa  328  3e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2254  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A protein  71.75 
 
 
229 aa  320  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0955089  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5585  coenzyme A transferase  71.69 
 
 
246 aa  320  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.81 
 
 
228 aa  319  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4435  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.86 
 
 
233 aa  317  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3667  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  72.99 
 
 
221 aa  316  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  73.06 
 
 
233 aa  316  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0865  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.04 
 
 
236 aa  312  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1036  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  66.67 
 
 
233 aa  310  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.138374  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4594  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70.42 
 
 
228 aa  307  8e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3946  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.12 
 
 
233 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.358275 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3550  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.3 
 
 
231 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520535  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2873  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.84 
 
 
231 aa  304  9.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.34 
 
 
233 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4072  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.01 
 
 
219 aa  300  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1120  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.78 
 
 
225 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.15 
 
 
220 aa  300  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5561  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.47 
 
 
233 aa  298  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.670135  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1506  coenzyme A transferase  69.12 
 
 
232 aa  295  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825778  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1229  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  65.62 
 
 
238 aa  295  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000422585  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.54 
 
 
219 aa  292  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138899  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1113  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70.05 
 
 
231 aa  292  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0564  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.35 
 
 
232 aa  290  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.802929  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0526  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.82 
 
 
232 aa  288  6e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.35 
 
 
232 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1680  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.35 
 
 
232 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514841  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1730  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.35 
 
 
232 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1702  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  66.35 
 
 
232 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.125286  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1076  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  64.22 
 
 
221 aa  284  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190915  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5059  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  62.22 
 
 
226 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00434544  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3086  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.9 
 
 
221 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.82 
 
 
227 aa  278  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.359655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4403  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.51 
 
 
232 aa  270  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189982  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  59.36 
 
 
276 aa  261  6e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3710  3-oxoacid CoA-transferase  60.73 
 
 
236 aa  259  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0600  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  59.36 
 
 
235 aa  257  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0638  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  58.9 
 
 
235 aa  256  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1846  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.27 
 
 
228 aa  255  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3720  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.36 
 
 
235 aa  252  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5885  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.45 
 
 
235 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.26 
 
 
235 aa  249  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6120  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  58.9 
 
 
235 aa  249  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6799  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.53 
 
 
235 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704148  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5020  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.14 
 
 
249 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1504  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.91 
 
 
223 aa  245  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2918  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.62 
 
 
233 aa  223  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000077275 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4027  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.68 
 
 
223 aa  221  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.071671  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1505  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.92 
 
 
237 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571069  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.07 
 
 
229 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  54.46 
 
 
234 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  54.5 
 
 
244 aa  214  8e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2761  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.69 
 
 
234 aa  214  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527249  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.96 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.96 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  53.96 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.96 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.96 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1563  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.61 
 
 
234 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.96 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4553  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.3 
 
 
254 aa  211  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.233149  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  48.82 
 
 
229 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  51.98 
 
 
302 aa  209  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.23 
 
 
245 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1163  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  48.4 
 
 
235 aa  209  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  48.84 
 
 
237 aa  209  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0959  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
235 aa  209  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248714  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6963  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47 
 
 
231 aa  209  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.550727  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  48.44 
 
 
238 aa  207  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  50.5 
 
 
237 aa  207  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2343  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.9 
 
 
252 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000394864  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  49.1 
 
 
238 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.48 
 
 
234 aa  207  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  46.08 
 
 
253 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1390  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.49 
 
 
234 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>