More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4027 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4027  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 		 223 aa  444  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.071671  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4622  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  87.28 
 
 		 277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5059  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  52.75 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00434544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0067  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  52.05 
 
 		 282 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200296  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1483  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  52.05 
 
 		 282 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  52.05 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1552  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  52.05 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0056  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  52.05 
 
 		 282 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1200  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  52.05 
 
 		 282 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1076  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.51 
 
 		 221 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0054  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  52.05 
 
 		 282 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  51.6 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0643  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A (pcaI)  50.23 
 
 		 233 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.371061  normal  0.0641252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2597  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.46 
 
 		 230 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5288  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.68 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.68 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2254  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A protein  52.91 
 
 		 229 aa  224  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0955089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3593  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.92 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.310124  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3951  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  50.92 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1871  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.46 
 
 		 231 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5289  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.92 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3129  3-oxoadipate CoA-transferase  49.32 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3086  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.14 
 
 		 221 aa  222  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3158  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.77 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5017  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.77 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.77 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5113  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  49.77 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.77 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0503398 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0865  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.23 
 
 		 236 aa  221  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2459  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.07 
 
 		 231 aa  221  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.695651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.68 
 
 		 225 aa  221  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2066  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.07 
 
 		 231 aa  221  7e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0689657  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.32 
 
 		 235 aa  221  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3946  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.23 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.358275 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3667  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  50.72 
 
 		 221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.08 
 
 		 219 aa  218  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138899  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5585  coenzyme A transferase  49.31 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1262  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  49.32 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4435  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.4 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0564  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.17 
 
 		 232 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.802929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1036  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  48.86 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.138374  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6120  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  48.39 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.06 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.72 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1229  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  49.55 
 
 		 238 aa  211  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000422585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5561  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.66 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.670135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2873  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.58 
 
 		 231 aa  211  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3550  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.58 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0600  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  47.93 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.47 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.92 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6799  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.69 
 
 		 235 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704148  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0638  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  47.47 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0526  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.25 
 
 		 232 aa  207  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1730  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.25 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.25 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1680  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.25 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1702  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  47.25 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.125286  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  45.21 
 
 		 276 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.86 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4072  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.17 
 
 		 219 aa  206  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3720  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.54 
 
 		 235 aa  204  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4594  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.17 
 
 		 228 aa  204  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5885  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.76 
 
 		 235 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1120  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.55 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3710  3-oxoacid CoA-transferase  44.5 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4403  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.84 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5020  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.8 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1506  coenzyme A transferase  48.88 
 
 		 232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825778  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2732  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.54 
 
 		 234 aa  194  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1892  acetate CoA-transferase, subunit A  47.47 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.47 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.47 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1113  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.72 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2851  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2978  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1714  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.47 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1525  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1163  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  45.16 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  45.16 
 
 		 253 aa  190  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1667  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.54 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1453  3-oxoacid CoA-transferase  45.62 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00126643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1504  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.96 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.16 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.16 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  46.51 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.41 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359655 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.91 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.91 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3228  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.24 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.761635  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4553  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.79 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.233149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2251  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  47 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1846  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.71 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1357  3-oxoacid CoA-transferase  47.69 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1505  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7914  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.5 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  45.41 
 
 		 463 aa  178  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  44.14 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.62 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>