More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7914 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7914  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 
240 aa  482  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.87 
 
 
250 aa  328  6e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.13 
 
 
255 aa  322  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.92 
 
 
274 aa  322  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4892  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70.24 
 
 
252 aa  317  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2343  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.89 
 
 
252 aa  314  6e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000394864  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4337  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.97 
 
 
269 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765282  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.07 
 
 
236 aa  308  5e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07030  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.66 
 
 
255 aa  305  4.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0351  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.39 
 
 
236 aa  300  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.901849  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.66 
 
 
233 aa  298  5e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07610  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.92 
 
 
269 aa  298  7e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4893  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.8 
 
 
254 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  62.61 
 
 
229 aa  294  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  65.12 
 
 
237 aa  292  4e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  62.13 
 
 
302 aa  291  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  61.7 
 
 
234 aa  291  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  64.5 
 
 
244 aa  291  7e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  61.28 
 
 
234 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  61.37 
 
 
232 aa  290  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  61.28 
 
 
234 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  61.28 
 
 
234 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12526  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase alpha subunit scoA  62.9 
 
 
248 aa  290  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399784  normal  0.0529319 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  61.28 
 
 
234 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  61.28 
 
 
234 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  61.28 
 
 
234 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.52 
 
 
233 aa  290  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.13 
 
 
234 aa  289  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  61.97 
 
 
233 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08500  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.27 
 
 
259 aa  287  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.494503 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  65.42 
 
 
237 aa  286  2e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4610  3-oxoacid CoA-transferase  61.7 
 
 
234 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000693974  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.52 
 
 
235 aa  286  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1390  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.85 
 
 
234 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1563  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.28 
 
 
234 aa  285  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2761  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.43 
 
 
234 aa  285  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527249  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2918  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.55 
 
 
233 aa  285  5.999999999999999e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000077275 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2504  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  58.62 
 
 
263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.361118  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0330  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.81 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.02 
 
 
229 aa  280  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.4 
 
 
272 aa  279  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17570  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  66.38 
 
 
232 aa  279  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1706  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.13 
 
 
233 aa  278  4e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.87 
 
 
245 aa  276  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.87 
 
 
245 aa  276  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.44 
 
 
255 aa  276  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  65.88 
 
 
244 aa  276  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1153  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  62.23 
 
 
232 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5001  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.68 
 
 
246 aa  272  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0462314  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6963  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.09 
 
 
231 aa  272  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.550727  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4164  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.43 
 
 
254 aa  272  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.7 
 
 
234 aa  272  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.62 
 
 
267 aa  272  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1163  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  56.52 
 
 
235 aa  272  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.87 
 
 
233 aa  272  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.62 
 
 
239 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.54 
 
 
244 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.7 
 
 
270 aa  270  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1598  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, alpha subunit  60.43 
 
 
239 aa  270  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.844563  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3228  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.65 
 
 
234 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.761635  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0517  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.44 
 
 
243 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1453  3-oxoacid CoA-transferase  56.22 
 
 
237 aa  270  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00126643  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  55.65 
 
 
253 aa  270  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.9 
 
 
233 aa  268  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1670  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  56.84 
 
 
235 aa  268  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.835044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1368  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  62.9 
 
 
263 aa  268  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1386  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.9 
 
 
263 aa  268  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315902  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.65 
 
 
234 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.65 
 
 
234 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0888  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.96 
 
 
233 aa  268  8e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0983  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  60.43 
 
 
234 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1465  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.43 
 
 
234 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1443  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.43 
 
 
234 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158358  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2732  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.22 
 
 
234 aa  267  8.999999999999999e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1892  acetate CoA-transferase, subunit A  56.22 
 
 
234 aa  267  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1402  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.5 
 
 
263 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.893267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1350  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.43 
 
 
234 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2851  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.22 
 
 
234 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1525  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.22 
 
 
234 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01941  putative succinyl-CoA transferase, alpha subunit  56.71 
 
 
235 aa  266  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546528  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2978  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.22 
 
 
234 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3055  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.66 
 
 
234 aa  266  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.184306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.22 
 
 
234 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.14 
 
 
233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2431  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.91 
 
 
232 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1505  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.43 
 
 
237 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571069  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.04 
 
 
463 aa  265  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.26 
 
 
235 aa  265  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.83 
 
 
245 aa  265  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1714  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.79 
 
 
234 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1366  3-oxoacid CoA-transferase  60.85 
 
 
234 aa  264  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.77 
 
 
237 aa  263  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2340  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  56.09 
 
 
234 aa  264  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1667  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.79 
 
 
234 aa  263  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.4 
 
 
233 aa  262  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.33 
 
 
245 aa  262  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4266  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.34 
 
 
235 aa  262  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.367586  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1961  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.48 
 
 
235 aa  262  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1762  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.48 
 
 
235 aa  262  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.83 
 
 
235 aa  262  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>