More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2504 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2504  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  100 
 
 
263 aa  518  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.361118  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2343  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.32 
 
 
252 aa  324  8.000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000394864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.37 
 
 
255 aa  313  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0330  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.84 
 
 
257 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08500  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.89 
 
 
259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.494503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.24 
 
 
250 aa  304  8.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4337  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.26 
 
 
269 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765282  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07610  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.7 
 
 
269 aa  300  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12526  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase alpha subunit scoA  65.35 
 
 
248 aa  298  7e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399784  normal  0.0529319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.69 
 
 
274 aa  297  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07030  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.01 
 
 
255 aa  296  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4892  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.49 
 
 
252 aa  296  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4893  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.71 
 
 
254 aa  289  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4164  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.66 
 
 
254 aa  285  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1402  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.99 
 
 
263 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.893267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.99 
 
 
261 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1386  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.6 
 
 
263 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315902  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1368  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  62.6 
 
 
263 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7914  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.7 
 
 
240 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  55.08 
 
 
232 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  54.3 
 
 
233 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.16 
 
 
234 aa  257  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.91 
 
 
235 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.65 
 
 
244 aa  255  6e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  52.92 
 
 
302 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  57.14 
 
 
244 aa  252  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  53.31 
 
 
234 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  50.59 
 
 
237 aa  250  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  52.92 
 
 
234 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  52.92 
 
 
234 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  52.92 
 
 
234 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  52.92 
 
 
234 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  52.92 
 
 
234 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  52.92 
 
 
234 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1563  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.56 
 
 
234 aa  248  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1153  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  54.69 
 
 
232 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0351  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.77 
 
 
236 aa  246  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.901849  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4610  3-oxoacid CoA-transferase  52.14 
 
 
234 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000693974  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.39 
 
 
233 aa  246  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.16 
 
 
272 aa  245  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.72 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  50.2 
 
 
237 aa  244  9e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.75 
 
 
234 aa  244  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.39 
 
 
233 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.2 
 
 
235 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.76 
 
 
235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1390  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.97 
 
 
234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2761  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.61 
 
 
234 aa  242  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527249  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3847  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.77 
 
 
236 aa  241  9e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584651  normal  0.485272 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0517  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.94 
 
 
243 aa  240  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.22 
 
 
237 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.98 
 
 
245 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.74 
 
 
267 aa  239  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.8 
 
 
245 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.8 
 
 
245 aa  239  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3823  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.16 
 
 
242 aa  239  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  47.64 
 
 
253 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1163  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  50.39 
 
 
235 aa  238  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4701  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.95 
 
 
242 aa  238  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196334  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.78 
 
 
233 aa  237  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.02 
 
 
233 aa  237  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.2 
 
 
229 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.2 
 
 
236 aa  237  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  49.43 
 
 
238 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.21 
 
 
255 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  50.2 
 
 
229 aa  235  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  49.81 
 
 
238 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2340  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  47.45 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  48.46 
 
 
511 aa  233  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.41 
 
 
237 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1706  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.38 
 
 
233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.9 
 
 
270 aa  232  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  49.24 
 
 
463 aa  232  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6830  acetyl-CoA/acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  49.41 
 
 
242 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.261495  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1010  coenzyme A transferase  50.63 
 
 
329 aa  232  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436488  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.14 
 
 
233 aa  231  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1961  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.53 
 
 
235 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1762  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.53 
 
 
235 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01941  putative succinyl-CoA transferase, alpha subunit  47.6 
 
 
235 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546528  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.83 
 
 
239 aa  230  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17570  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  53.52 
 
 
232 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4635  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.02 
 
 
238 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.853485  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1456  3-oxoacid CoA-transferase  50.95 
 
 
235 aa  229  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0699745  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.81 
 
 
246 aa  229  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1914  3-ketoacid CoA transferase alpha subunit  48.63 
 
 
232 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0564  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.63 
 
 
232 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3950  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  48.28 
 
 
245 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1983  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.95 
 
 
233 aa  228  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1246  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  48.8 
 
 
235 aa  228  8e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5436  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  46.9 
 
 
235 aa  227  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1443  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.97 
 
 
234 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158358  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0590  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.24 
 
 
232 aa  227  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1505  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.36 
 
 
237 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571069  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6963  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.24 
 
 
231 aa  226  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.550727  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0888  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.64 
 
 
233 aa  227  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5001  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.14 
 
 
246 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0462314  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0983  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  50.58 
 
 
234 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1465  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.58 
 
 
234 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.08 
 
 
244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1350  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.58 
 
 
234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>