More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07030 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_07030  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 
255 aa  510  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4893  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  79.13 
 
 
254 aa  418  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.95 
 
 
250 aa  354  7.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.47 
 
 
255 aa  352  4e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.87 
 
 
274 aa  343  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12526  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase alpha subunit scoA  71.49 
 
 
248 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399784  normal  0.0529319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2343  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.76 
 
 
252 aa  334  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000394864  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4337  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.35 
 
 
269 aa  330  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4892  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  73.49 
 
 
252 aa  324  9e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2504  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  63.81 
 
 
263 aa  311  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.361118  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08500  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.48 
 
 
259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.494503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4164  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.9 
 
 
254 aa  308  5.9999999999999995e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1402  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.34 
 
 
263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.893267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0330  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.88 
 
 
257 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1386  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.94 
 
 
263 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315902  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1368  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  66.94 
 
 
263 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7914  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.07 
 
 
240 aa  299  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.95 
 
 
261 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839059 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07610  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.23 
 
 
269 aa  292  3e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  59.59 
 
 
229 aa  289  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0351  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.79 
 
 
236 aa  276  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.901849  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  57.72 
 
 
232 aa  271  6e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  56.5 
 
 
233 aa  271  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.07 
 
 
229 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.06 
 
 
245 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.45 
 
 
233 aa  268  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  54.94 
 
 
237 aa  268  5e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  57.03 
 
 
244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.91 
 
 
235 aa  267  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.84 
 
 
233 aa  266  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.06 
 
 
236 aa  266  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  54.15 
 
 
237 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.6 
 
 
245 aa  265  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.6 
 
 
245 aa  265  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.15 
 
 
245 aa  265  8e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.74 
 
 
255 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56 
 
 
272 aa  262  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1163  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  54.88 
 
 
235 aa  262  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  54.47 
 
 
302 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  55.28 
 
 
234 aa  261  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  55.28 
 
 
234 aa  261  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  55.28 
 
 
234 aa  261  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  55.28 
 
 
234 aa  261  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  55.28 
 
 
234 aa  261  6e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  55.28 
 
 
234 aa  261  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  57.43 
 
 
244 aa  261  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6830  acetyl-CoA/acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  54.62 
 
 
242 aa  261  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.261495  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  55.28 
 
 
234 aa  261  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.33 
 
 
235 aa  260  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01941  putative succinyl-CoA transferase, alpha subunit  53.41 
 
 
235 aa  260  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546528  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.33 
 
 
267 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.75 
 
 
246 aa  259  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0888  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.84 
 
 
233 aa  258  6e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1563  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.47 
 
 
234 aa  258  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.47 
 
 
235 aa  258  8e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1390  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.88 
 
 
234 aa  258  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2761  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.66 
 
 
234 aa  257  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527249  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1153  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  57.72 
 
 
232 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.23 
 
 
239 aa  257  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  52.99 
 
 
253 aa  257  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05669  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase (ScoT), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12250)  52.8 
 
 
519 aa  257  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1706  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.49 
 
 
233 aa  257  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.1 
 
 
238 aa  256  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.38 
 
 
234 aa  256  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.07 
 
 
234 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5001  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.39 
 
 
246 aa  255  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0462314  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4610  3-oxoacid CoA-transferase  54.47 
 
 
234 aa  255  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000693974  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0517  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.09 
 
 
243 aa  255  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.06 
 
 
233 aa  254  7e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2918  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.23 
 
 
233 aa  254  8e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000077275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6963  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.88 
 
 
231 aa  254  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.550727  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  53.85 
 
 
238 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  54.66 
 
 
238 aa  254  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3055  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.05 
 
 
234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.184306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4635  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.7 
 
 
238 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.853485  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1670  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  54.07 
 
 
235 aa  251  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.835044  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.69 
 
 
233 aa  251  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0590  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.06 
 
 
232 aa  251  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1598  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, alpha subunit  56.73 
 
 
239 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.844563  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.82 
 
 
233 aa  250  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51610  3-oxoacid CoA-transferase  57.14 
 
 
232 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1983  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.69 
 
 
233 aa  250  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1505  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.38 
 
 
237 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571069  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.2 
 
 
244 aa  249  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1010  coenzyme A transferase  55.65 
 
 
329 aa  250  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436488  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1246  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  54.51 
 
 
235 aa  250  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3228  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.23 
 
 
234 aa  248  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.761635  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2431  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.92 
 
 
232 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3122  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  55.51 
 
 
232 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.408127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2594  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.51 
 
 
232 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2735  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.51 
 
 
232 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  52.65 
 
 
511 aa  246  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3950  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  53.42 
 
 
245 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2076  3-oxoacid CoA-transferase  54.07 
 
 
232 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.51 
 
 
270 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3295  putative CoA transferase, subunit A  55.92 
 
 
232 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2340  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  51 
 
 
234 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38660  putative CoA transferase, subunit A  55.92 
 
 
232 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.59 
 
 
237 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1961  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.66 
 
 
235 aa  245  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>