More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08500 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_08500  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 
259 aa  522  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.494503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2343  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.82 
 
 
252 aa  333  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000394864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.55 
 
 
255 aa  323  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4893  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.95 
 
 
254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.02 
 
 
250 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2504  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  58.89 
 
 
263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.361118  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0330  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.19 
 
 
257 aa  308  5e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.24 
 
 
274 aa  303  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07030  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.63 
 
 
255 aa  300  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4892  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.43 
 
 
252 aa  296  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4337  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.92 
 
 
269 aa  296  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765282  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12526  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase alpha subunit scoA  60.39 
 
 
248 aa  292  5e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399784  normal  0.0529319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4164  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.92 
 
 
254 aa  286  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1368  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  59.32 
 
 
263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1386  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.32 
 
 
263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315902  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1402  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.94 
 
 
263 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.893267 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07610  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.18 
 
 
269 aa  280  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.11 
 
 
261 aa  275  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7914  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.69 
 
 
240 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.65 
 
 
233 aa  265  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  54.76 
 
 
237 aa  263  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.9 
 
 
244 aa  261  6.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  54.51 
 
 
233 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1563  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.9 
 
 
234 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.31 
 
 
234 aa  258  5.0000000000000005e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.52 
 
 
272 aa  256  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  54.12 
 
 
302 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.75 
 
 
233 aa  256  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  54.12 
 
 
234 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.12 
 
 
234 aa  255  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.73 
 
 
234 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  53.73 
 
 
234 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.73 
 
 
234 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.73 
 
 
234 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.73 
 
 
234 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.73 
 
 
234 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  53.97 
 
 
237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.94 
 
 
235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  54.26 
 
 
244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  53.73 
 
 
232 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.36 
 
 
245 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1390  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.73 
 
 
234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.69 
 
 
245 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1153  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  56.47 
 
 
232 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4610  3-oxoacid CoA-transferase  53.73 
 
 
234 aa  251  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000693974  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  50.59 
 
 
253 aa  251  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.17 
 
 
233 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.81 
 
 
239 aa  249  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2761  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.94 
 
 
234 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527249  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.97 
 
 
245 aa  248  6e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.97 
 
 
245 aa  248  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.17 
 
 
270 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.12 
 
 
267 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1453  3-oxoacid CoA-transferase  51.78 
 
 
237 aa  246  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00126643  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1456  3-oxoacid CoA-transferase  54.09 
 
 
235 aa  246  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0699745  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1670  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  51.57 
 
 
235 aa  245  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.835044  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1914  3-ketoacid CoA transferase alpha subunit  52.76 
 
 
232 aa  245  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0564  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.76 
 
 
232 aa  245  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.69 
 
 
233 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2732  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.57 
 
 
234 aa  244  8e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2978  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.96 
 
 
234 aa  244  9e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2851  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.96 
 
 
234 aa  244  9e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1525  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.96 
 
 
234 aa  244  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.19 
 
 
255 aa  244  9e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.96 
 
 
234 aa  244  9e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1983  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.69 
 
 
233 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.58 
 
 
244 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1892  acetate CoA-transferase, subunit A  52.17 
 
 
234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.17 
 
 
463 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.59 
 
 
231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1714  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.57 
 
 
234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1667  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.57 
 
 
234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.39 
 
 
233 aa  243  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.17 
 
 
234 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.17 
 
 
234 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17570  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  55.91 
 
 
232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  49.4 
 
 
229 aa  242  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1961  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.73 
 
 
235 aa  242  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1762  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.73 
 
 
235 aa  242  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3055  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.75 
 
 
234 aa  241  6e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.184306 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0590  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.01 
 
 
232 aa  241  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2340  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  49.62 
 
 
234 aa  241  7.999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.06 
 
 
236 aa  241  9e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2431  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.36 
 
 
232 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.03 
 
 
237 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.38 
 
 
233 aa  240  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01941  putative succinyl-CoA transferase, alpha subunit  48.24 
 
 
235 aa  241  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546528  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2635  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.51 
 
 
239 aa  239  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3122  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  52.96 
 
 
232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.408127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2594  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.96 
 
 
232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.17 
 
 
235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.97 
 
 
238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2735  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.96 
 
 
232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3228  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.78 
 
 
234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.761635  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1905  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  54.47 
 
 
235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4164  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.39 
 
 
235 aa  239  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1598  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, alpha subunit  53.36 
 
 
239 aa  238  9e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.844563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0959  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.38 
 
 
235 aa  236  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248714  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.15 
 
 
246 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4683  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
245 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.728384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>