More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4553 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4553  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 
254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.233149  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.63 
 
 
235 aa  247  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  53.51 
 
 
238 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1010  coenzyme A transferase  53.51 
 
 
329 aa  243  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436488  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.95 
 
 
245 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.95 
 
 
245 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1246  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.63 
 
 
235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.51 
 
 
255 aa  241  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  53.51 
 
 
238 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.09 
 
 
235 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4635  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.38 
 
 
238 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.853485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  51.75 
 
 
229 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6830  acetyl-CoA/acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  53.07 
 
 
242 aa  238  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.261495  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.44 
 
 
229 aa  237  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3950  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.19 
 
 
245 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  53.28 
 
 
232 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2123  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.19 
 
 
236 aa  236  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.678104  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  51.95 
 
 
237 aa  235  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  51.3 
 
 
237 aa  234  8e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5001  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.52 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0462314  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.19 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1163  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.86 
 
 
235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.19 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.44 
 
 
235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2918  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.78 
 
 
233 aa  233  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000077275 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.08 
 
 
233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.8 
 
 
272 aa  232  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1153  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  54.15 
 
 
232 aa  231  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  51.09 
 
 
233 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  51.75 
 
 
244 aa  231  8.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6963  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.34 
 
 
231 aa  231  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.550727  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5436  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  51.1 
 
 
235 aa  230  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3823  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.59 
 
 
242 aa  230  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.88 
 
 
234 aa  230  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0564  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.65 
 
 
232 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1914  3-ketoacid CoA transferase alpha subunit  50.65 
 
 
232 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507414  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0959  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.09 
 
 
235 aa  229  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248714  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  52.79 
 
 
244 aa  228  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0888  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.89 
 
 
233 aa  228  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.54 
 
 
267 aa  227  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0517  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.84 
 
 
243 aa  227  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.1 
 
 
236 aa  226  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.33 
 
 
233 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
237 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4337  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.98 
 
 
269 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765282  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.08 
 
 
233 aa  225  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  47.58 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.35 
 
 
270 aa  225  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.93 
 
 
231 aa  225  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  51.97 
 
 
302 aa  224  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  46.75 
 
 
276 aa  223  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4610  3-oxoacid CoA-transferase  51.53 
 
 
234 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000693974  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  51.53 
 
 
234 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  51.53 
 
 
234 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  51.53 
 
 
234 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1453  3-oxoacid CoA-transferase  50 
 
 
237 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00126643  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  51.53 
 
 
234 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.53 
 
 
234 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4683  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.91 
 
 
245 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.728384 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  51.53 
 
 
234 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  51.53 
 
 
234 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1390  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.53 
 
 
234 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.32 
 
 
233 aa  222  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0351  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.33 
 
 
236 aa  222  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.901849  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.62 
 
 
233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  51.53 
 
 
234 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.08 
 
 
235 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1871  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.93 
 
 
231 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1892  acetate CoA-transferase, subunit A  50.44 
 
 
234 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  48.62 
 
 
237 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.56 
 
 
233 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1505  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.86 
 
 
237 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571069  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.44 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.44 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3951  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  50.46 
 
 
231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1563  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.22 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3228  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.57 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.761635  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2340  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  48.37 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3593  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.46 
 
 
231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.310124  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.7 
 
 
233 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3108  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.22 
 
 
232 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0784994  normal  0.0838265 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0643  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A (pcaI)  49.07 
 
 
233 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.371061  normal  0.0641252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2597  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.54 
 
 
230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1961  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.39 
 
 
235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1762  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.39 
 
 
235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1983  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.95 
 
 
233 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1714  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
234 aa  218  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.78 
 
 
244 aa  218  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4164  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.52 
 
 
235 aa  218  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1667  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
234 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0067  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  47.71 
 
 
282 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200296  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3129  3-oxoadipate CoA-transferase  47.25 
 
 
237 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1120  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.85 
 
 
225 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2732  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.12 
 
 
234 aa  217  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1483  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  47.71 
 
 
282 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5289  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
231 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1552  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  47.71 
 
 
237 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0056  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  47.71 
 
 
282 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.77 
 
 
250 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3467  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.7 
 
 
235 aa  216  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>