More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3037 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 
228 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70.14 
 
 
235 aa  329  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2254  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A protein  72.35 
 
 
229 aa  327  9e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0955089  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2066  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.89 
 
 
231 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0689657  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2459  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.89 
 
 
231 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.695651  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.23 
 
 
233 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2597  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.89 
 
 
230 aa  325  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0643  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A (pcaI)  70 
 
 
233 aa  324  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.371061  normal  0.0641252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5289  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.89 
 
 
231 aa  324  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3951  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  68.86 
 
 
231 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  67.42 
 
 
237 aa  322  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1552  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  67.42 
 
 
237 aa  322  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0067  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  67.87 
 
 
282 aa  322  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200296  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3593  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.86 
 
 
231 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.310124  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1871  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.42 
 
 
231 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5017  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.33 
 
 
238 aa  322  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3158  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.33 
 
 
238 aa  322  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913746  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0054  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  67.42 
 
 
282 aa  321  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0056  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  67.42 
 
 
282 aa  321  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1200  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  67.42 
 
 
282 aa  321  5e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1483  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  67.42 
 
 
282 aa  321  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5288  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.33 
 
 
237 aa  321  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595074  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  67.42 
 
 
237 aa  321  8e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3129  3-oxoadipate CoA-transferase  68.33 
 
 
237 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.33 
 
 
238 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  72.81 
 
 
225 aa  319  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5113  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  68.33 
 
 
238 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.33 
 
 
238 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503398 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1262  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  69.59 
 
 
230 aa  314  6e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5585  coenzyme A transferase  68.66 
 
 
246 aa  310  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3667  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  68.9 
 
 
221 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5561  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.21 
 
 
233 aa  298  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.670135  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3946  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.06 
 
 
233 aa  295  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.358275 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2873  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60 
 
 
231 aa  294  7e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3550  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.55 
 
 
231 aa  293  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520535  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1036  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  62.21 
 
 
233 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.138374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4435  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.67 
 
 
233 aa  291  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0865  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.16 
 
 
236 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1120  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.28 
 
 
225 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1113  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.12 
 
 
231 aa  289  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.9 
 
 
233 aa  286  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4594  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.85 
 
 
228 aa  284  5.999999999999999e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.43 
 
 
233 aa  283  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.75 
 
 
219 aa  281  7.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138899  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4072  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.62 
 
 
219 aa  281  8.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.67 
 
 
220 aa  278  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1229  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  62.16 
 
 
238 aa  275  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000422585  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  60.27 
 
 
276 aa  274  9e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1504  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.06 
 
 
223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1506  coenzyme A transferase  64.98 
 
 
232 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825778  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0526  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.11 
 
 
232 aa  272  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0564  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.5 
 
 
232 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.802929  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1730  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.62 
 
 
232 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1680  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.62 
 
 
232 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514841  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.62 
 
 
232 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5059  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  59.91 
 
 
226 aa  269  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00434544  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1702  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  62.62 
 
 
232 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.125286  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4403  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.93 
 
 
232 aa  266  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189982  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3086  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.14 
 
 
221 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5885  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.56 
 
 
235 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3710  3-oxoacid CoA-transferase  58.15 
 
 
236 aa  265  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.64 
 
 
227 aa  264  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.359655 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6799  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.18 
 
 
235 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704148  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1076  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  58.99 
 
 
221 aa  261  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190915  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0600  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  59.26 
 
 
235 aa  256  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0638  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  58.8 
 
 
235 aa  255  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1846  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.66 
 
 
228 aa  255  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6120  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  57.87 
 
 
235 aa  255  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.62 
 
 
235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3720  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.33 
 
 
235 aa  250  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5020  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.11 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1505  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.87 
 
 
237 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571069  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6963  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.09 
 
 
231 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.550727  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.4 
 
 
229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1163  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  49.54 
 
 
235 aa  211  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4553  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.56 
 
 
254 aa  210  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.233149  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  53.85 
 
 
234 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.32 
 
 
236 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4027  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.92 
 
 
223 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.071671  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2918  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.3 
 
 
233 aa  209  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000077275 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  50.68 
 
 
229 aa  208  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.37 
 
 
234 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.37 
 
 
234 aa  207  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  53.37 
 
 
234 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.37 
 
 
234 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.37 
 
 
234 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.37 
 
 
234 aa  207  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.96 
 
 
237 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.07 
 
 
244 aa  206  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  46.76 
 
 
253 aa  204  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.15 
 
 
233 aa  204  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1563  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.67 
 
 
234 aa  204  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2364  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  56.02 
 
 
233 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0372161  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3228  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.61 
 
 
234 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.761635  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.15 
 
 
234 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.15 
 
 
234 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.7 
 
 
255 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  51.92 
 
 
302 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1500  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.48 
 
 
233 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1595  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.48 
 
 
233 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>