More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1506 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1506  coenzyme A transferase  100 
 
 
232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825778  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  69.12 
 
 
237 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2459  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70.97 
 
 
231 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.695651  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2066  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70.97 
 
 
231 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0689657  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1483  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  69.12 
 
 
282 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0067  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  69.12 
 
 
282 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200296  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5288  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.66 
 
 
237 aa  316  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595074  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  69.12 
 
 
237 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1552  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  69.12 
 
 
237 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0056  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  69.12 
 
 
282 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1200  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  69.12 
 
 
282 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.96 
 
 
233 aa  316  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0054  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  69.12 
 
 
282 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0643  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A (pcaI)  67.74 
 
 
233 aa  314  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.371061  normal  0.0641252 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3158  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.66 
 
 
238 aa  314  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913746  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5017  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.66 
 
 
238 aa  314  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.26 
 
 
235 aa  314  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2597  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.71 
 
 
230 aa  314  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4435  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.14 
 
 
233 aa  313  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.2 
 
 
238 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5113  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  68.2 
 
 
238 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.2 
 
 
238 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3129  3-oxoadipate CoA-transferase  66.82 
 
 
237 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.12 
 
 
225 aa  311  6.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3951  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  67.26 
 
 
231 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3593  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.26 
 
 
231 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.310124  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1871  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.82 
 
 
231 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2254  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A protein  68.16 
 
 
229 aa  308  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0955089  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0865  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.26 
 
 
236 aa  306  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5289  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.66 
 
 
231 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5585  coenzyme A transferase  67.28 
 
 
246 aa  305  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3946  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.67 
 
 
233 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.358275 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3667  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  69.42 
 
 
221 aa  301  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5561  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.6 
 
 
233 aa  296  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.670135  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1036  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  61.5 
 
 
233 aa  295  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.138374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.2 
 
 
233 aa  293  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2873  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.27 
 
 
231 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3550  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.27 
 
 
231 aa  292  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520535  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.98 
 
 
228 aa  291  8e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1229  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  64.5 
 
 
238 aa  287  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000422585  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0564  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.99 
 
 
232 aa  285  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.802929  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.82 
 
 
219 aa  285  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138899  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0526  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.03 
 
 
232 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.06 
 
 
227 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.359655 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1730  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.55 
 
 
232 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.55 
 
 
232 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1680  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.55 
 
 
232 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514841  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1262  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  62.21 
 
 
230 aa  279  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1702  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  65.55 
 
 
232 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.125286  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.86 
 
 
233 aa  278  4e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4594  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.33 
 
 
228 aa  277  8e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3086  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.21 
 
 
221 aa  276  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1113  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.06 
 
 
231 aa  274  9e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.29 
 
 
220 aa  273  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4072  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.33 
 
 
219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1120  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.67 
 
 
225 aa  272  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4403  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.2 
 
 
232 aa  270  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189982  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1076  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  59.28 
 
 
221 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190915  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5059  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  57.96 
 
 
226 aa  268  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00434544  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3710  3-oxoacid CoA-transferase  56.71 
 
 
236 aa  263  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  54.78 
 
 
276 aa  257  9e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1504  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.17 
 
 
223 aa  252  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6799  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.78 
 
 
235 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704148  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5885  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.78 
 
 
235 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0600  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  54.35 
 
 
235 aa  241  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0638  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  53.91 
 
 
235 aa  241  7e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6120  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  55.09 
 
 
235 aa  239  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5020  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.11 
 
 
249 aa  234  7e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3720  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.61 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.7 
 
 
235 aa  231  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1846  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.67 
 
 
228 aa  228  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2761  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.21 
 
 
234 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527249  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1563  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.29 
 
 
234 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  50.68 
 
 
237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.13 
 
 
233 aa  215  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4027  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.54 
 
 
223 aa  214  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.071671  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.07 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  51.39 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  51.14 
 
 
302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  53.7 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1163  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  49.77 
 
 
235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.38 
 
 
234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  50.69 
 
 
244 aa  211  5.999999999999999e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  51.83 
 
 
234 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  51.38 
 
 
234 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  51.38 
 
 
234 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  51.38 
 
 
234 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  51.38 
 
 
234 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  51.38 
 
 
234 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  51.38 
 
 
234 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1390  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.92 
 
 
234 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  49.3 
 
 
229 aa  208  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1505  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.7 
 
 
237 aa  207  9e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571069  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.33 
 
 
237 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1366  3-oxoacid CoA-transferase  53.21 
 
 
234 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4610  3-oxoacid CoA-transferase  50 
 
 
234 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000693974  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
233 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.54 
 
 
236 aa  205  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51 
 
 
245 aa  205  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51 
 
 
245 aa  204  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>