More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0564 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0564  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 
232 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.802929  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0526  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  95.26 
 
 
232 aa  441  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  94.83 
 
 
232 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1730  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  94.83 
 
 
232 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1702  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  94.83 
 
 
232 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.125286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1680  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  94.83 
 
 
232 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514841  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  77.53 
 
 
227 aa  337  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.359655 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  74.18 
 
 
219 aa  328  6e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138899  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  71.43 
 
 
235 aa  314  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70 
 
 
233 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4403  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.42 
 
 
232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189982  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  68.84 
 
 
237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0643  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A (pcaI)  69.05 
 
 
233 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.371061  normal  0.0641252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2066  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.37 
 
 
231 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0689657  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2459  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.37 
 
 
231 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.695651  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2873  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.21 
 
 
231 aa  304  7e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5288  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.1 
 
 
237 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595074  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5585  coenzyme A transferase  70.48 
 
 
246 aa  304  9.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3550  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.21 
 
 
231 aa  304  9.000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520535  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5017  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.57 
 
 
238 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3158  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.57 
 
 
238 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913746  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0865  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.98 
 
 
236 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4435  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.4 
 
 
233 aa  302  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3667  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  69.05 
 
 
221 aa  302  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3946  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.36 
 
 
233 aa  301  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.358275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1871  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.67 
 
 
231 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.62 
 
 
238 aa  300  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5113  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  67.62 
 
 
238 aa  300  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.62 
 
 
238 aa  300  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503398 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0067  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  68.57 
 
 
282 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200296  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3951  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  66.21 
 
 
231 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1483  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  68.57 
 
 
282 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  68.57 
 
 
237 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3593  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.21 
 
 
231 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.310124  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1552  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  68.57 
 
 
237 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0054  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  68.57 
 
 
282 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3129  3-oxoadipate CoA-transferase  67.14 
 
 
237 aa  300  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1200  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  68.57 
 
 
282 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0056  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  68.57 
 
 
282 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2254  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A protein  64.89 
 
 
229 aa  299  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0955089  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2597  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.45 
 
 
230 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5561  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.62 
 
 
233 aa  297  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.670135  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5289  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.94 
 
 
231 aa  295  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1036  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  64.11 
 
 
233 aa  291  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.138374  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.1 
 
 
220 aa  290  9e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1113  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.91 
 
 
231 aa  290  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.35 
 
 
225 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.4 
 
 
233 aa  289  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4594  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.98 
 
 
228 aa  288  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4072  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.67 
 
 
219 aa  287  8e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.3 
 
 
233 aa  283  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1229  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  63.59 
 
 
238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000422585  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1262  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  60.95 
 
 
230 aa  273  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.5 
 
 
228 aa  271  5.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1120  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  69.23 
 
 
225 aa  271  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1506  coenzyme A transferase  66.99 
 
 
232 aa  268  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825778  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3086  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.52 
 
 
221 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  56.28 
 
 
276 aa  253  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5059  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  61.65 
 
 
226 aa  252  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00434544  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3710  3-oxoacid CoA-transferase  58.45 
 
 
236 aa  244  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1076  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  56.04 
 
 
221 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190915  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0600  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  54.55 
 
 
235 aa  238  6.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6120  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  54.29 
 
 
235 aa  238  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0638  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  54.55 
 
 
235 aa  237  9e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3720  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.05 
 
 
235 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1504  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.94 
 
 
223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.67 
 
 
235 aa  231  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6799  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.67 
 
 
235 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704148  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5885  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.21 
 
 
235 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1846  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.81 
 
 
228 aa  227  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5020  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.49 
 
 
249 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2732  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.46 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4027  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.17 
 
 
223 aa  214  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.071671  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  48.56 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.1 
 
 
245 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  51.42 
 
 
238 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
234 aa  211  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
234 aa  211  9e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1892  acetate CoA-transferase, subunit A  49.53 
 
 
234 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  45.92 
 
 
237 aa  209  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.76 
 
 
233 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1714  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.07 
 
 
234 aa  207  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.83 
 
 
245 aa  207  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.43 
 
 
235 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  49.53 
 
 
238 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3228  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.76 
 
 
234 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.761635  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1667  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.53 
 
 
234 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.31 
 
 
237 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4635  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
238 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.853485  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1505  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.07 
 
 
237 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571069  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2851  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.07 
 
 
234 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.87 
 
 
229 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.07 
 
 
234 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2978  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.07 
 
 
234 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1525  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.07 
 
 
234 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6830  acetyl-CoA/acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  49.53 
 
 
242 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.261495  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1453  3-oxoacid CoA-transferase  49.28 
 
 
237 aa  205  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00126643  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1163  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  48.6 
 
 
235 aa  205  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>