98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2328 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  100 
 
 		 295 aa  596  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  77.57 
 
 		 273 aa  434  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  74.34 
 
 		 273 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  73.96 
 
 		 271 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  75.66 
 
 		 276 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  67.61 
 
 		 285 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  66.9 
 
 		 285 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  67.25 
 
 		 285 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  75.1 
 
 		 265 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  69.43 
 
 		 283 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  69.81 
 
 		 283 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  65.73 
 
 		 289 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  71.64 
 
 		 286 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  64.15 
 
 		 273 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  62.64 
 
 		 271 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  60 
 
 		 285 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  51.7 
 
 		 304 aa  275  7e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  41.35 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  38.43 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  40.68 
 
 		 317 aa  148  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  31.45 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  35.93 
 
 		 599 aa  123  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  31.77 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  33.21 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  31.73 
 
 		 305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  35.63 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  35.42 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  32 
 
 		 313 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  32.62 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  30.58 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  29.48 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  31.56 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  29.57 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  31.15 
 
 		 251 aa  102  9e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  34.11 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  31.64 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  32.51 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  34.13 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  33.33 
 
 		 268 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  32.69 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  34.56 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  30.26 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  28.83 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  32.35 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  32.43 
 
 		 272 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  31.58 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  34.92 
 
 		 590 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  30.88 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  32.44 
 
 		 272 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  30.47 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  30.82 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  33.46 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  30 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  32.13 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  30.48 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  29.89 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  29.69 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  30.57 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  31.02 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  29.41 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  31.03 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.14 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  28.72 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  30.47 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  30.08 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  29.57 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  32.18 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  29.69 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  29.69 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  29.69 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.41 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.41 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.89 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2003  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.87 
 
 		 220 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.881736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.55 
 
 		 235 aa  49.3  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.18 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.44 
 
 		 228 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1961  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.07 
 
 		 235 aa  46.2  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1762  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.07 
 
 		 235 aa  46.2  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  25.81 
 
 		 276 aa  45.8  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  28.73 
 
 		 220 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3550  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.43 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  24.31 
 
 		 237 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2504  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  30.36 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.361118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.47 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2490  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.99 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.7 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.86 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2873  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.99 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3720  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.56 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3823  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.24 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3847  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.4 
 
 		 236 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584651  normal  0.485272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32.17 
 
 		 238 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.02 
 
 		 225 aa  42.7  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.15 
 
 		 217 aa  42.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28 
 
 		 215 aa  42.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  24.19 
 
 		 237 aa  42.4  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1036  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.42 
 
 		 233 aa  42.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.138374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>