229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1584 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  100 
 
 		 286 aa  586  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  75.94 
 
 		 273 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  75.19 
 
 		 271 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  72.66 
 
 		 273 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  71.64 
 
 		 295 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  66.07 
 
 		 285 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  69.74 
 
 		 283 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  65.71 
 
 		 285 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  67.77 
 
 		 285 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  68.63 
 
 		 283 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  67.16 
 
 		 289 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  70.66 
 
 		 276 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  63.7 
 
 		 271 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  68.97 
 
 		 265 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  62.41 
 
 		 273 aa  355  2.9999999999999997e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  63.14 
 
 		 285 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  50.52 
 
 		 304 aa  280  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  37.23 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  36.17 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  36.27 
 
 		 317 aa  145  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  33.92 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  38.02 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  31.76 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  31.89 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  33.45 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  33.45 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  37.14 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  38.81 
 
 		 599 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  32.11 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  34.66 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  33.74 
 
 		 268 aa  109  6e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  34 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  31.03 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  28.2 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  30.67 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  32.09 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  31.07 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  31.86 
 
 		 302 aa  95.5  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  30.25 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  31.49 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  30.29 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  32.21 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  30.88 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  30.37 
 
 		 272 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  31.54 
 
 		 320 aa  86.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  28.62 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  29.56 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  31.08 
 
 		 280 aa  86.3  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  29.28 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  31.09 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  30.59 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  30.14 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  28.04 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  29.1 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  29.84 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  32.54 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  30.99 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  28.76 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  29.25 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  30.89 
 
 		 590 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  28.76 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  28.76 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  30.77 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  30.56 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  27.67 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  28.01 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  30.3 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.16 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  25.27 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.09 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  28.72 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.14 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  27.15 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  26.87 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.57 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.02 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.27 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.14 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.78 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.58 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  28.19 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2597  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.38 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3720  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.83 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.32 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.09 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.79 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.79 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3951  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  27.35 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  26.79 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  27.51 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2873  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.56 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1871  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.94 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.73 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3593  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.35 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.310124  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.94 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.67 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3550  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.56 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.89 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.05 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2504  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  29.8 
 
 		 263 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.361118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>