More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3751 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  100 
 
 		 298 aa  606  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  67.81 
 
 		 293 aa  391  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  63.95 
 
 		 296 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  60.54 
 
 		 297 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  55.97 
 
 		 291 aa  329  4e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  54.79 
 
 		 294 aa  326  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  57.25 
 
 		 289 aa  314  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  56.88 
 
 		 286 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  57.51 
 
 		 290 aa  310  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  56.32 
 
 		 280 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  58.18 
 
 		 293 aa  301  9e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  54.51 
 
 		 280 aa  299  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  61.04 
 
 		 261 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  54.45 
 
 		 281 aa  288  7e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  49.28 
 
 		 295 aa  255  7e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  48.92 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  49.1 
 
 		 292 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  47.02 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  48.56 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  48.2 
 
 		 295 aa  248  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  48.2 
 
 		 295 aa  248  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  35.29 
 
 		 305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  36.65 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  34.82 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  32.26 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  33.56 
 
 		 599 aa  122  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  33.21 
 
 		 317 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  32.51 
 
 		 329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  32.71 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  33.2 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  30 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  31.4 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  27.89 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  30.23 
 
 		 332 aa  96.3  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  34.13 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  33.98 
 
 		 271 aa  93.6  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  30.65 
 
 		 313 aa  92.4  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  32.46 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  28.06 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  32.4 
 
 		 590 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  33.33 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  30.71 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32.34 
 
 		 246 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  29.39 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  29.01 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  28.38 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  29.39 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  29.84 
 
 		 285 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  34.02 
 
 		 265 aa  86.3  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  29.84 
 
 		 289 aa  85.5  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  29.48 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  29.1 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  30.74 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  28.24 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  29.45 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  29.88 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  29.82 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  30.77 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.77 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.95 
 
 		 238 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  29.02 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  27.52 
 
 		 506 aa  75.9  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  27.69 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  30.73 
 
 		 220 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  26.83 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.55 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32.66 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138899  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.64 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  28.76 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.85 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  27.34 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.42 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  30 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  30 
 
 		 220 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.08 
 
 		 245 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1140  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  33.14 
 
 		 232 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.373341 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.08 
 
 		 245 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  30 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.21 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  28.95 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2105  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.02 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.897892  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1670  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  30.54 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.835044  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.23 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.16 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.29 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.41 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2290  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.5 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  26.41 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  30 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3237  3-oxoacid CoA-transferase  35.43 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.870367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0590  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.03 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3455  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A family  34.86 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  28.46 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3086  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.87 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  26.79 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1036  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  29.65 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.138374  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3823  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.05 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>