More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4842 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  100 
 
 		 305 aa  616  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  85.86 
 
 		 305 aa  528  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  52.79 
 
 		 329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  37.05 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  39.33 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  36.58 
 
 		 276 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  41.67 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  33.81 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  32.66 
 
 		 268 aa  143  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  35.69 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  35.47 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  34.57 
 
 		 280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  31.8 
 
 		 289 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  36.88 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  35.11 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  32.52 
 
 		 599 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  31.99 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  38.43 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  36.3 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  34.32 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  35.29 
 
 		 298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  34.81 
 
 		 286 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  30.26 
 
 		 322 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  35.69 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  33.92 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  33.92 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  33.92 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  34.28 
 
 		 289 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  31.79 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  34.02 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  33.7 
 
 		 295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  31.07 
 
 		 283 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  33.6 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  36.18 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  32.96 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  31.99 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  35.22 
 
 		 273 aa  125  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  36.25 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  33.58 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  33.92 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  34.21 
 
 		 272 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  33.71 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  28.1 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  34.34 
 
 		 313 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  32.62 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  32.01 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  30.88 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  31.48 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  33.56 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  35.32 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  31.11 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  30.71 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  31.89 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  25 
 
 		 326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  33.33 
 
 		 285 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  32.8 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  31.73 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  34.72 
 
 		 272 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  31.15 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  30.77 
 
 		 273 aa  109  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  26.98 
 
 		 325 aa  105  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  32.66 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  31.96 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  32.67 
 
 		 590 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  27.81 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  26.91 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  27.91 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  27.02 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  26.67 
 
 		 320 aa  86.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.12 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.92 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.85 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.88 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.17 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.94 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.4 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.44 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.64 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1983  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.4 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.27 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12526  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase alpha subunit scoA  27.51 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399784  normal  0.0529319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.46 
 
 		 245 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  28.7 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2635  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  30.72 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.35 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.02 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.95 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.25 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.27 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.44 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.91 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.91 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  27.54 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  28.44 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  28.44 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.47 
 
 		 233 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1905  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  30.12 
 
 		 235 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.09 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2343  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.52 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000394864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  28.99 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>