71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3923 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  100 
 
 
304 aa  620  1e-177  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  50.71 
 
 
285 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  53.45 
 
 
273 aa  281  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  50.71 
 
 
285 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  51.07 
 
 
285 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  50.18 
 
 
273 aa  279  5e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  51.7 
 
 
295 aa  275  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  50.71 
 
 
283 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  50.71 
 
 
283 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  51.12 
 
 
273 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  50 
 
 
271 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  47.77 
 
 
289 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  51.32 
 
 
271 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  50.35 
 
 
286 aa  265  7e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  52.67 
 
 
276 aa  264  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  50.19 
 
 
265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  43.97 
 
 
285 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  40.62 
 
 
297 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  34 
 
 
332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  30.25 
 
 
326 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  29.14 
 
 
325 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  28.44 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  32.65 
 
 
299 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  30.88 
 
 
305 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  30.65 
 
 
325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  33.73 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  35.45 
 
 
599 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  31.58 
 
 
305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  30.57 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  31.41 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  31.68 
 
 
321 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  34.52 
 
 
251 aa  110  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  30.45 
 
 
320 aa  109  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  32.49 
 
 
313 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  32.08 
 
 
302 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  32.39 
 
 
300 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  33.86 
 
 
276 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  30.48 
 
 
276 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  31.3 
 
 
317 aa  97.4  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  30.88 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  29.79 
 
 
297 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  29.37 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  30.71 
 
 
280 aa  89.4  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  29.96 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  29.39 
 
 
298 aa  87  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  25.82 
 
 
329 aa  85.9  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  31.44 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  29.63 
 
 
272 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  31.13 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  30.25 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  30.71 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  26.71 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  29.05 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  27.65 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  29.05 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  28.98 
 
 
296 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  28.52 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  28.72 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  28.72 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  29.55 
 
 
590 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  28.52 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  28.62 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  28.62 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  28.77 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  28.86 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  27.11 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  27.92 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  29.5 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  30.99 
 
 
272 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  29.32 
 
 
461 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2003  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  25.43 
 
 
220 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.881736  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>