159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2837 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  100 
 
 		 271 aa  548  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  75.56 
 
 		 273 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  75.75 
 
 		 273 aa  424  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  73.96 
 
 		 295 aa  415  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  73.56 
 
 		 265 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  75.19 
 
 		 286 aa  391  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  69.73 
 
 		 276 aa  387  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  67.55 
 
 		 285 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  67.55 
 
 		 285 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  67.17 
 
 		 285 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  69.06 
 
 		 283 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  69.06 
 
 		 283 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  67.82 
 
 		 289 aa  374  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  63.43 
 
 		 273 aa  355  5e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  62.78 
 
 		 271 aa  355  5.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  63.57 
 
 		 285 aa  342  4e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  51.32 
 
 		 304 aa  265  5e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  39.76 
 
 		 297 aa  171  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  35.14 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  38.59 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  39.04 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  36.18 
 
 		 305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  37.67 
 
 		 599 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  33.71 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  34.33 
 
 		 329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  34.63 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  31.56 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  36.8 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  29.88 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  36.2 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  28.52 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  32.77 
 
 		 251 aa  95.5  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  33.98 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  30.53 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  32.41 
 
 		 280 aa  92.8  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  31.37 
 
 		 280 aa  92.8  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  35.85 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  31.18 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  33.46 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  29.55 
 
 		 302 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  31.47 
 
 		 293 aa  89  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  29.74 
 
 		 289 aa  89  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  31.34 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  34.45 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  27.82 
 
 		 300 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  35 
 
 		 269 aa  85.9  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  34.58 
 
 		 296 aa  85.5  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  29.63 
 
 		 281 aa  85.5  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  28.19 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  28.2 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  34.02 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  31.8 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  32.14 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  31.93 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  31.47 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  30.39 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  30.77 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  28 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  30.8 
 
 		 296 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  30.32 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  30.36 
 
 		 590 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  29.75 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  30.68 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  32.75 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  29.92 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  29.92 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  33.9 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  28.99 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.68 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.07 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  27.88 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1229  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  30.17 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000422585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.68 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2873  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.41 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.77 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3550  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.41 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.8 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.86 
 
 		 229 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.9 
 
 		 235 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1036  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.72 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.138374  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  29.54 
 
 		 461 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  26.61 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.51 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0638  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  26.99 
 
 		 235 aa  49.7  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.56 
 
 		 215 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.44 
 
 		 463 aa  49.3  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25 
 
 		 245 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  25.23 
 
 		 237 aa  49.3  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  25.88 
 
 		 232 aa  49.3  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4892  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.21 
 
 		 252 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.23 
 
 		 233 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  26.51 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3946  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.09 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.358275 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.67 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1983  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.52 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  25.69 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  26.07 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2504  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  28.92 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.361118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.52 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.71 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>