264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3982 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  100 
 
 		 297 aa  613  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  65.88 
 
 		 296 aa  401  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  66.21 
 
 		 292 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  65.07 
 
 		 295 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  63.92 
 
 		 295 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  64.26 
 
 		 295 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  64.26 
 
 		 295 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  60.75 
 
 		 290 aa  347  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  58.42 
 
 		 289 aa  325  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  57.89 
 
 		 280 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  58.45 
 
 		 280 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  56.67 
 
 		 293 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  55.63 
 
 		 286 aa  299  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  53.43 
 
 		 281 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  58.2 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  47.02 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  48.07 
 
 		 294 aa  244  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  47.77 
 
 		 296 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  47.35 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  48.04 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  44.17 
 
 		 291 aa  219  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  34.22 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  31.96 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  31.84 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  35.87 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  28.87 
 
 		 599 aa  89.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  27.92 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  28.27 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  26.78 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  28.46 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  28.75 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  29.67 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  25.38 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.86 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  32.79 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  27.63 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  29.5 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32.94 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  28.99 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  27.9 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6120  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  28.91 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2105  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.93 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.897892  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  29.37 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  27.8 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  28.11 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.36 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  28.72 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  25.63 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  23.96 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.71 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  26.09 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  25.9 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.63 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  25.72 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  27.34 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.08 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.48 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.48 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  26.69 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.48 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3720  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.36 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6799  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.78 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0600  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  28.03 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  31.61 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  26.47 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.1 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  23.33 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  25.7 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3086  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.97 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.64 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  26.26 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0638  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  26.78 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  27.75 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07030  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.71 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.59 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  24.73 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0888  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.39 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  25.25 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  28.17 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.17 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12526  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase alpha subunit scoA  28.99 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399784  normal  0.0529319 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.69 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5885  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.23 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  28.17 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0643  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A (pcaI)  25.94 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.371061  normal  0.0641252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  28.17 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4072  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.02 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.9 
 
 		 233 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.88 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.89 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  26.11 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.31 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2504  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.46 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.361118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  28.17 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4893  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.18 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  26.87 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.87 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.87 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.87 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  23.88 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>