106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_38220 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  100 
 
 		 289 aa  593  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  89.01 
 
 		 283 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  89.01 
 
 		 283 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  86.83 
 
 		 285 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  86.48 
 
 		 285 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  86.27 
 
 		 285 aa  511  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  70.99 
 
 		 273 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  68.91 
 
 		 273 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  65.73 
 
 		 295 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  65.93 
 
 		 273 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  67.82 
 
 		 271 aa  374  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  62.59 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  67.16 
 
 		 286 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  67.29 
 
 		 276 aa  371  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  66.28 
 
 		 265 aa  362  4e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  63.16 
 
 		 285 aa  351  8e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  47.77 
 
 		 304 aa  267  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  36.16 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  36.2 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  31.8 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  32.69 
 
 		 326 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  34.46 
 
 		 317 aa  135  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  32.51 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  29.14 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  35.22 
 
 		 599 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  31.92 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  38.01 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  29.78 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  31.89 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  30.29 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  33.47 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  30.17 
 
 		 299 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  28.66 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  30.13 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  30.46 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  29.92 
 
 		 268 aa  99.4  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  31.1 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  30.29 
 
 		 321 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  32.86 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  33.33 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  29.62 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  31.75 
 
 		 272 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  30.65 
 
 		 251 aa  93.2  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  28.72 
 
 		 331 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  28.62 
 
 		 281 aa  89.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  28.68 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  28.72 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  31.64 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  30.86 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  30.74 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  29.84 
 
 		 298 aa  85.5  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  30.88 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  30.3 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  27.05 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  29.21 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  28.81 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  31.8 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  28.68 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  30.92 
 
 		 590 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  29.45 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  28.52 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  28.72 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  27.96 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  28.24 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  27.39 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  27.39 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  27.39 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  33.92 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  26.47 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  28.79 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.64 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.15 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  28.28 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.65 
 
 		 246 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.79 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.15 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.36 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  26.63 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.13 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2340  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  25.76 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5436  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  26.9 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  27.64 
 
 		 234 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2635  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.59 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1961  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.75 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1983  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.65 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1762  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.75 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.65 
 
 		 233 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  28.64 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  27.14 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  27.14 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  27.14 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  27.14 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  27.14 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  27.14 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.5 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  28.11 
 
 		 511 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.07 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1383  acetate CoA-transferase  34.15 
 
 		 217 aa  43.1  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2504  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  27.05 
 
 		 263 aa  43.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.361118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>