87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1134 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  100 
 
 		 299 aa  629  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  30.65 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  32.79 
 
 		 329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  32.65 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  28.92 
 
 		 332 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  30.2 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  31.15 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  31.01 
 
 		 313 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  27.69 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  30.58 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  30.71 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  31.71 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  29.34 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  30.45 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  31.06 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  28.98 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  29.88 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  30.6 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  30.17 
 
 		 289 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  30.29 
 
 		 276 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  29.2 
 
 		 599 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  27.6 
 
 		 331 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  31.4 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  28.93 
 
 		 283 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  28.51 
 
 		 283 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  29.75 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  30.17 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  29.75 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  30.77 
 
 		 291 aa  95.9  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  29.05 
 
 		 285 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  27.43 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  29.27 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  26.72 
 
 		 322 aa  89.7  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  28.16 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  27.23 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  29.05 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  26.46 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  29.06 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  28.22 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  28.84 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  29.06 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  29.32 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  28.79 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  27.54 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  31.69 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  27.04 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  25.52 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  28.04 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  26.52 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  27.31 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  31.16 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  25.1 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  26.46 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  26.97 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  30 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  26.34 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  27.63 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  27.02 
 
 		 590 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  25.41 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  27.08 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  25.93 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  25.93 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  25.1 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  25.51 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  29.38 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3086  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.11 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  29.38 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  28.64 
 
 		 268 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.45 
 
 		 217 aa  52.8  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  24.89 
 
 		 276 aa  52.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  24.89 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  28.75 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0865  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.96 
 
 		 236 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4337  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.27 
 
 		 269 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765282  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.22 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3169  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  24.27 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2277  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.04 
 
 		 218 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  27.66 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.58 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  24.55 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.11 
 
 		 215 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2873  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.13 
 
 		 231 aa  43.5  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3550  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.13 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1162  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  24.27 
 
 		 218 aa  43.5  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1076  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  25.84 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23 
 
 		 233 aa  43.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.24 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>