250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1489 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  100 
 
 
296 aa  607  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  91.55 
 
 
295 aa  568  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  90.14 
 
 
295 aa  560  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  90.14 
 
 
295 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  90.14 
 
 
295 aa  560  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  79.51 
 
 
292 aa  488  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  65.88 
 
 
297 aa  401  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  60.88 
 
 
290 aa  357  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  59.51 
 
 
280 aa  330  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  59.15 
 
 
289 aa  329  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  59.04 
 
 
293 aa  329  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  58.8 
 
 
280 aa  328  9e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  57.49 
 
 
286 aa  318  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  53.96 
 
 
281 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  58.98 
 
 
261 aa  295  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  47.89 
 
 
294 aa  257  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  48.92 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  48.93 
 
 
293 aa  236  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  45.55 
 
 
296 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  43.46 
 
 
291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  44.6 
 
 
297 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  36.46 
 
 
305 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  35.69 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  34.41 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  31.3 
 
 
276 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  32 
 
 
276 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  30.1 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  28.73 
 
 
268 aa  96.3  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  29.13 
 
 
317 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  29.12 
 
 
599 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  27.43 
 
 
300 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  31.85 
 
 
313 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  31.47 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  26.09 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  30.5 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  28.98 
 
 
304 aa  79  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  25.68 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  25.26 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  27.54 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  30.91 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  27.96 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6120  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  29.22 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  27.67 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  27.21 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  24.41 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.1 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  31.64 
 
 
590 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  27 
 
 
283 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  26.67 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  26.51 
 
 
285 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  28.37 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3720  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.39 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  24.27 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  31.15 
 
 
276 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.23 
 
 
235 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  25.1 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  35.15 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0888  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.63 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1113  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.05 
 
 
231 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  27.05 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3086  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.24 
 
 
221 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  28.57 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4893  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.29 
 
 
254 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  23.67 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0600  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  30.17 
 
 
235 aa  64.7  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.29 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6799  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.08 
 
 
235 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704148  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0638  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  29.75 
 
 
235 aa  63.5  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  30.47 
 
 
295 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4594  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.81 
 
 
228 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.75 
 
 
225 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1262  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  27.35 
 
 
230 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  27.69 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.39 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.34 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.26 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.92 
 
 
228 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  26.23 
 
 
268 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.9 
 
 
235 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5885  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.17 
 
 
235 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  27.05 
 
 
272 aa  60.1  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0526  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.55 
 
 
232 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.16 
 
 
220 aa  59.3  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.89 
 
 
233 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2597  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.5 
 
 
230 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7914  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.27 
 
 
240 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.47 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4072  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.52 
 
 
219 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5561  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.31 
 
 
233 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.670135  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07030  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.57 
 
 
255 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.76 
 
 
229 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1702  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  25.11 
 
 
232 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.125286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1680  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.11 
 
 
232 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514841  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27 
 
 
246 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1730  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.11 
 
 
232 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.11 
 
 
232 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.63 
 
 
221 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3951  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  28.16 
 
 
231 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1871  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.16 
 
 
231 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0643  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A (pcaI)  25.11 
 
 
233 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.371061  normal  0.0641252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>