More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3297 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  100 
 
 		 293 aa  587  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  67.81 
 
 		 298 aa  404  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  62.37 
 
 		 296 aa  358  7e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  60 
 
 		 297 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  56.31 
 
 		 294 aa  319  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  57.35 
 
 		 289 aa  296  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  54.95 
 
 		 280 aa  294  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  61.6 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  54.21 
 
 		 280 aa  288  9e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  55.48 
 
 		 293 aa  286  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  52.54 
 
 		 290 aa  286  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  51.03 
 
 		 291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  53.68 
 
 		 286 aa  281  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  54.71 
 
 		 281 aa  278  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  48.93 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  48.93 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  48.21 
 
 		 295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  48.21 
 
 		 295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  48.21 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  48.4 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  48.04 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  36.55 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  33.91 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  33.86 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  32.28 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  31.62 
 
 		 599 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  34.63 
 
 		 251 aa  120  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  32.65 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  33.72 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  30.48 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  29.37 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  33.98 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  27.39 
 
 		 325 aa  95.9  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  31.5 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  33.62 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  30.3 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  31.8 
 
 		 269 aa  89.4  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  30.31 
 
 		 332 aa  89  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  25.68 
 
 		 325 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.17 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32.16 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.66 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  27.24 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.25 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  26.07 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  30.13 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.71 
 
 		 237 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  30.87 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  32.68 
 
 		 590 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2105  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32.67 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.897892  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  29.3 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  33.9 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  26.95 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  30.49 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  27.69 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  25.82 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  29.87 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3847  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32.16 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1153  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  32.94 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32.14 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  33.05 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  29.6 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.55 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.17 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  33.21 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  32.17 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.57 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.68 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  26.78 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.82 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  32.17 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  30.57 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1983  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.58 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.42 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5436  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  31.96 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  29.22 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  26.16 
 
 		 506 aa  72.4  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  31.07 
 
 		 220 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.07 
 
 		 220 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.99 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.05 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  31.6 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.77 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  28.08 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  33.17 
 
 		 219 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138899  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1871  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.89 
 
 		 231 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.77 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  31.07 
 
 		 220 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  28.95 
 
 		 244 aa  72  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  31.9 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1505  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.82 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.29 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  31.07 
 
 		 220 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3951  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  30.49 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3593  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.49 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.310124  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1383  acetate CoA-transferase  31.19 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  31.6 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  32.84 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.93 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1762  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.58 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>